Pareizā antibiotiku deva parasti ir atkarīga no zāļu veida, bakteriālās infekcijas smaguma un rakstura, kā arī no tās personas vecuma un svara, kura saņem zāles. Noteiktā daudzuma lietošana un visa antibiotiku kursa pabeigšana parasti tiek uzskatīti par galvenajiem veiksmīgas ārstēšanas elementiem. Antibiotikas lieto dažādu baktēriju izraisītu veselības problēmu ārstēšanai, un tās nav efektīvas pret vīrusiem. Tos dažreiz izraksta arī kā profilakses līdzekli cilvēkiem, kuriem ir augsts nopietnas bakteriālas infekcijas risks. Antibiotikām ir vairākas priekšrocības, taču ir arī dažas blakusparādības, kā arī daži jauni baktēriju celmi, kas iztur antibiotiku ārstēšanu.
Kad ārsts aprēķina antibiotikas devu, sākotnējais apsvērums ir tas, kuras zāles ir labākā izvēle baktēriju apkarošanai. Katrai antibiotikai ir vispārīgas dozēšanas vadlīnijas bērniem un pieaugušajiem. Lielākā daļa ārstu tad ņems vērā infekcijas smaguma pakāpi, kā arī indivīda vecumu, svaru un slimības vēsturi, lai noteiktu optimālo antibiotiku devu un grafiku. Vēl viens faktors, kas jāņem vērā, ir tas, vai ārsts dod priekšroku bakteriālas slimības ārstēšanai ar ātrāko, lielāko iespējamo devu, vai arī uzskata, ka labākā izvēle ir mazāka deva ilgākā laika periodā.
Antibiotiku kursa pabeigšana, kā noteikts, tiek uzskatīta par svarīgu zāļu efektivitātes sastāvdaļu. Iemesls pareizas antibiotiku devas ievērošanai ieteiktajā laika posmā ir samērā vienkāršs. Ja kāds agri pārtrauc zāļu lietošanu, pastāv ievērojams risks, ka baktērijas netiks pilnībā izvadītas un infekcija var atkārtoties. Šādos gadījumos infekcijas rezultātā var būt nepieciešama lielāka antibiotiku deva, un bakteriālās infekcijas ārstēšanai nepieciešamais laiks var būt ilgāks.
Vēl viens jautājums, kas jāapsver, ir antibiotiku iespējamās blakusparādības. Dažas biežas blakusparādības ir slikta dūša, caureja un vemšana. Citas blakusparādības, piemēram, maksts rauga infekcijas un gremošanas trakta un mutes sēnīšu infekcijas, parasti ir saistītas ar antibiotiku nevienmērīgo raksturu. Šīs zāles nenošķir labvēlīgās baktērijas no baktērijām, kas izraisa slimību, un darbosies, lai nogalinātu vai kavētu jebkādu organismā esošo baktēriju augšanu.
Tiek uzskatīts, ka pārmērīga antibiotiku lietošana vai to nepareiza lietošana ir galvenais faktors pret zālēm rezistentu baktēriju celmu parādīšanos. Tādas baktērijas kā pret meticilīnu rezistentais Staphylococcus aureus (MRSA) ir izrādījušās ārkārtīgi grūti ārstējamas, un tās ir radījušas nopietnas problēmas slimnīcās. MRSA celmu ārstēšanas kurss ir sarežģīts, jo lielākā daļa variantu ir rezistenti pret visām antibiotikām, izņemot dažas.