Suši pieaugošā popularitāte ir radījusi zināmas bažas par tā ieguvumiem veselībai. Tāpat kā jebkura cita pārtika, arī no suši pastāv risks saindēties ar pārtiku, ja sastāvdaļas ir vecas, nav atdzesētas vai nav apstrādātas saskaņā ar pārtikas un drošības noteikumiem. Vienmēr pārliecinieties, ka lietojat suši no uzticama avota, un jo rosīgāks ir veikals, jo lielāka iespēja, ka ēdiens ir svaigs.
Lai izvairītos no saindēšanās ar pārtiku no suši, ir ļoti svarīgi, lai pagatavošanas vieta un izmantotais aprīkojums būtu tīrs, jo īpaši tāpēc, ka process ir saistīts ar neapstrādātu pārtiku. Suši bāros jebkurai vitrīnai jābūt ar durvīm, lai pasargātu pārtiku no piesārņojuma un nodrošinātu pareizu temperatūras uzturēšanu. Populārs suši ēšanas veids ir šķīvju paņemšana no konveijera sistēmas, un tādā gadījumā visas šķīvjus ir jānosedz.
Lielākais suši saindēšanās ar pārtiku cēlonis ir fakts, ka galvenā sastāvdaļa ir neapstrādātas zivis. Anisakiāze ir stāvokļa nosaukums, ko izraisa apaļo tārpu vai nematožu kāpuru uzņemšana, kas dažkārt atrodas jēlās zivīs. Cilvēki inficējas, ēdot jēlas vai nepietiekami termiski apstrādātas zivis, kas bija apaļtārpu saimnieki. Anisakīda kāpuri iekļūst kuņģa un zarnu gļotādā, kas izraisa akūtus saindēšanās ar pārtiku simptomus, piemēram, stipras sāpes vēderā, sliktu dūšu un vemšanu.
Vienīgais veids, kā novērst nejaušu anisakīdu kāpuru norīšanu, ir ēst zivis, kas ir pagatavotas vai sasaldētas ieteicamajā temperatūrā, kas nogalina kāpurus. Jābūt piesardzīgiem, pasūtot suši ikvienā restorānā, kurā netiek izmantota pirmā sasaldētā zivs. Saindēšanās ar pārtiku no suši biežums ir lielāks apgabalos, kur jēlas zivis tiek ēst biežāk, piemēram, Japānā un Nīderlandē.
Tika konstatēts, ka daudzās suši gatavošanā izmantotajās zivīs, īpaši tunzivī un lašos, piesārņojošo vielu, piemēram, dzīvsudraba, līmenis ir ievērojami lielāks par ieteiktajiem ierobežojumiem. Tomēr tas attiecas tikai uz zivīm, kas nozvejotas piekrastē, un parasti tas neattiecas uz saimniecībā audzētām zivīm. Šī iemesla dēļ ir svarīgi zināt, no kurienes zivis nāk.
Vēl viena suši sastāvdaļa ir skābēti rīsi. Rīsu paskābināšana līdz ieteicamajam līmenim, izmantojot rīsu etiķi, palīdz novērst patogēno baktēriju augšanu. Tomēr ir gadījumi, kad rīsi nav paskābināti līdz atbilstošam līmenim un, ja tie tiek turēti istabas temperatūrā ilgāk par dažām stundām, tas var izraisīt arī tādas problēmas kā saindēšanās ar pārtiku.
Lai novērstu saindēšanos ar pārtiku no suši, ļoti svarīgas ir zināšanas par tā ražošanas procesu un izmantoto sastāvdaļu avotu. Restorāniem un suši bāriem jābūt tīriem līdz sterilitātei, jo neapstrādāta pārtika ir jārīkojas pareizi saskaņā ar pārtikas drošības noteikumiem. Ikvienam, kurš gatavo suši mājās, ir arī jāapzinās, ka ir jāievēro stingri norādījumi.