Gan metronidazols, gan klindamicīns ir antibiotikas, taču atšķiras to darbības metodes, blakusparādības un infekciju veidi, ko tie parasti ārstē. Lai gan abas ir antibiotikas, metronidazols ir efektīvs infekcijām, ko izraisa anaerobās baktērijas un dažādi parazītiski vienšūņi. Klindamicīns ir efektīvs gan aerobām, gan anaerobām bakteriālām infekcijām un vienšūņiem, kas izraisa malāriju. Metronidazols traucē noteiktas šūnu funkcijas, izraisot baktēriju vai parazītu nāvi. Klindamicīns nenogalina baktērijas, drīzāk aptur to vairošanos.
Abas zāles ir pieejamas perorālā un lokālā veidā. Metronidazols ir pieejams tablešu, kapsulu, krēmu, losjonu, želeju un injekciju formā. Papildus šīm formām klindamicīns ir pieejams arī suspensijā iekšķīgai lietošanai, lokālās putās un šķīdumā pūtīšu ārstēšanai. Pūtīšu ārstēšanai izmanto arī klindamicīna un citu medikamentu kombinācijas.
Klindamicīns tiek parakstīts smagām bakteriālām infekcijām. Šī antibiotika ārstē ādas, asiņu, iekšējo orgānu infekcijas un citas infekcijas. Klindamicīnu lieto arī zobu infekciju ārstēšanai vai sirds infekciju profilaksei dažiem pacientiem, kuriem tiek veiktas zobārstniecības procedūras. Metronidazols cīnās ar anaerobām bakteriālām infekcijām plaušās, zarnās, locītavās un gremošanas orgānos. Turklāt to lieto, lai ārstētu slimības, ko izraisa vienšūņi, piemēram, amēba un Giardia.
Metronidazola un klindamicīna blakusparādībām ir dažas līdzības, taču arī vairākas būtiskas atšķirības. Visas antibiotikas var izraisīt zarnu labvēlīgās baktēriju floras traucējumus. Tas var izraisīt caureju un zarnu spazmas. Tomēr klindamicīns ir saistīts ar smagu zarnu stāvokli, ko izraisa pret zālēm rezistentas baktērijas. Pārmērīga rezistentu baktēriju savairošanās ārstēšanas laikā un pēc tās retos gadījumos var izraisīt potenciāli letālu stāvokli.
Gan metronidazols, gan klindamicīns parasti izraisa vieglu caureju, sliktu dūšu un vemšanu. Metronidazola blakusparādības pastiprinās alkohola lietošana un var izraisīt smagas paģiras. Citas bieži sastopamas metronidazola blakusparādības ir metāla garša mutē, galvassāpes un apetītes zudums. Cilvēki nedrīkst apgulties tūlīt pēc klindamicīna lietošanas, jo var rasties slikta dūša, grēmas vai caureja. Pacientiem ir ieteicams pastāstīt saviem veselības aprūpes sniedzējiem par jebkādiem neparastiem vai smagiem simptomiem, lietojot kādu no zālēm.
Vismaz vienā pētījumā tika secināts, ka metronidazolam un klindamicīnam bija atšķirības baktēriju rezistencē, ārstējot bakteriālo vaginozi sievietēm. Abas pētījumu grupas izmantoja vaginālo preparātu no metronidazola vai klindamicīna. Pētnieki atklāja, ka sievietēm, kuras tika ārstētas no bakteriālās vaginozes, bija ievērojami lielāka baktēriju rezistence pret klindamicīnu, īpaši pēc ārstēšanas kursa. Baktēriju rezistence pret metronidazolu bija ļoti maza. Viņi konstatēja Escherichia coli koncentrācijas palielināšanos grupā, kas tika ārstēta ar klindamicīnu, bet labvēlīgo Lactobacillus pieaugumu sievietēm, kuras tika ārstētas ar metronidazolu pēc ārstēšanas beigām.