Vairumā gadījumu kuņģa-zarnu trakta infekcija izzūd pati pēc dažām dienām, un tai nav nepieciešama īpaša medicīniska palīdzība. Svarīga ir pareiza hidratācija, tāpēc atveseļošanās laikā jālieto daudz šķidruma. Bezrecepšu vai recepšu medikamentus var lietot, lai ārstētu sliktu dūšu, kas saistīta ar kuņģa-zarnu trakta infekciju, lai gan zāles, kuru mērķis ir ārstēt caureju, parasti nav ieteicamas. Atkarībā no infekcijas cēloņa var izrakstīt antibiotikas, pretvīrusu zāles vai pretparazītu zāles. Jebkuri konkrēti jautājumi vai bažas par labākajām kuņģa-zarnu trakta infekciju ārstēšanas iespējām konkrētai situācijai ir jāapspriež ar ārstu vai citu medicīnas speciālistu.
Pareizas hidratācijas uzturēšana ir viena no galvenajām problēmām, ja ir kuņģa-zarnu trakta infekcija. Bieži vien pietiek ar daudz šķidruma dzeršanu, lai novērstu dehidratāciju. Papildus ūdenim un augļu sulām var ieteikt zupu vai buljonu. Apvienojot šos ēdienus un dzērienus, organismā tiek nomainīti gan šķidrumi, gan elektrolīti. Ja rodas dehidratācija, pacientam var būt nepieciešams intravenozi ievadīt šķidrumus slimnīcas apstākļos.
Slikta dūša un caureja ir visizplatītākie simptomi, kas saistīti ar kuņģa-zarnu trakta infekciju. Ja slikta dūša kļūst smaga un ir grūti samazināt šķidruma daudzumu, var būt noderīgi bezrecepšu vai recepšu pretslikta dūšas medikamenti. Parasti nav ieteicams lietot zāles, kas paredzētas caurejas ārstēšanai, jo tas palēninātu infekcijas avota izeju.
Antibiotikas parasti netiek parakstītas bakteriālai kuņģa-zarnu trakta infekcijai citādi veselam cilvēkam. Šīm zālēm ir tendence palielināt tādu simptomu kā caureja smagumu. Tiem, kuriem ir traucēta imūnsistēma, var ievadīt antibiotikas, jo ieguvumi būtu lielāki par iespējamo risku. Ja tiek konstatēts, ka infekciju izraisījis parazīts, var izrakstīt pretparazītu medikamentus, vai vīrusu infekciju gadījumā var izrakstīt pretvīrusu zāles.
Labākās ārstēšanas iespējas kuņģa-zarnu trakta infekcijas laikā parasti ir pietiekama šķidruma uzņemšana un daudz atpūtas. Šī ir samērā izplatīta bēda, kas parasti izzūd vienas nedēļas laikā. Ja simptomi saglabājas vai kļūst smagi, jākonsultējas ar ārstu, lai veiktu turpmāku medicīnisko pārbaudi. Var nozīmēt medikamentus, kas palīdz mazināt simptomus, vai var būt indicēta īslaicīga uzturēšanās slimnīcā, ja dehidratācija kļūst smaga un to nevar adekvāti ārstēt mājās. Infekciju vienmēr vislabāk diagnosticēt ārstam, jo dažiem nopietnākiem veselības stāvokļiem var būt līdzīgi simptomi.