Starp alkoholu un gremošanas sistēmu pastāv potenciāli destruktīvas attiecības, jo alkohols spēj sagraut siekalu dziedzerus, bojāt vielmaiņu un ierobežot barības vadu, norāda ārsti. Hroniska alkohola lietošana ne tikai palielina vēža risku dažām gremošanas sistēmas daļām, bet arī var traucēt ikdienas funkcijas. Gremošanas sistēma, kas sastāv no visa kuņģa-zarnu trakta, kā arī papildu ķermeņa daļām, kas palīdz metabolizēt pārtiku, lai tā uzsūktos, sastāv no vairākiem delikātiem orgāniem, kas ir jutīgi pret gļotādas un muskuļu bojājumiem, tostarp mutes dobumu, aknām, žultspūsli un barības vadu. . Gan tievās, gan resnās zarnas, kā arī aizkuņģa dziedzeris var ciest arī no asarām, polipiem un bojājumiem no alkohola lietošanas.
Mutes dobums ir pirmā vieta, kas pakļauta bojājumiem, ko rada nelabvēlīgā saikne starp alkoholu un gremošanas sistēmu. Siekalu dziedzeri mutē, īpaši pieauss siekalu dziedzeris, var palielināties, kavējot siekalu izdalīšanos, kas nepieciešamas, lai adekvāti nogaršotu un ieeļļotu pārtiku košļājamā fāzē — gremošanas sākuma fāzē. Alkohols var arī kairināt mēli un gļotādas mutes iekšpusē, izraisot to pietūkumu. Dažos medicīnas pētījumos alkohols ir arī viens no zobu zuduma un smaganu slimību cēloņiem.
Nepareiza barības vada darbība ir iespējama pēc ilgstošas alkohola un gremošanas sistēmas apvienošanas. Pētnieki saka, ka alkohola iedarbība samazina barības vada sfinktera muskuļu spēku, vājinot tā kontrakcijas. Ja tas notiek, daļēji sagremota pārtika un bojātā kuņģa skābe var plūst atpakaļ no kuņģa uz barības vadu, radot tādus simptomus kā grēmas; pētījumi liecina, ka alkohols var bīstami palielināt kuņģa skābes veidošanos kuņģī un arī samazināt muskuļu kontrakcijas. Visi šie efekti kopā var palēnināt pārtikas kustību caur gremošanas sistēmu.
Arī barības vada atvērums var kļūt nolietots un šaurāks, ierobežojot rīšanas spēju, regulāri sasaistot alkoholu ar gremošanas sistēmu. Pat ja fiziskajiem audiem kuņģī, barības vadā un zarnās izdodas izvairīties no pastāvīgas alkohola iedarbības radītā kaitējuma, alkohols joprojām var iznīcināt labās baktērijas gremošanas traktā, padarot organismu uzņēmīgāku pret kaitīgiem mikroorganismiem un slimībām. Noberztas oderes var izraisīt asiņošanu vai čūlas gan barības vadā, gan kuņģī. Ja asiņošana notiek tieši kuņģa un barības vada krustpunktā, to sauc par Mallory-Weiss sindromu, slimību, kas bieži sastopama alkoholiķiem. Gastrīts, kas ir kuņģa membrānas iekaisums, var rasties arī no regulāras alkohola lietošanas.
Ilgstošas un atkārtotas alkohola iedarbības gadījumā vēzis var rasties negatīvas attiecības starp alkoholu un gremošanas sistēmu dēļ. Baltas krāsas vēža bojājumi uz mēles var parādīties atsevišķi vai daudzkārt, radot mēles karcinomu. Bojājumi vai audzēji var parādīties arī vaigu iekšpusē vai uz barības vada, zarnu un kuņģa iekšējām sienām. Ārsti brīdina, ka alkohola un gremošanas sistēmas kombinācijas negatīvā ietekme, visticamāk, ir mēreniem vai smagiem dzērājiem, lai gan vieglas sekas, ko izraisa samazināts siekalu daudzums un palielināta kuņģa skābe, var rasties tiem, kas lieto alkoholu.