Šimpanžu uzvedība ir ļoti atšķirīga atkarībā no tā, kura no divām šimpanžu sugām tiek aplūkota – parastā šimpanze (Pan troglodytes), kas dzīvo uz ziemeļiem no Kongo upes, un Bonobo (Pan paniscus), kas dzīvo dienvidos. Lai gan šīs šimpanzes ir gandrīz neatšķiramas anatomiski – aptuveni 75–155 mārciņas (35–70 kg), 0.9–1.2 m (3–4 pēdas) augstumā, ar vidējo dzīves ilgumu 30–40 — to uzvedība nevar būt savādāks.
Parastā šimpanze ir visizplatītākā un ļaunākā no abām. Medī karaspēkā, parastās šimpanzes dzīvo ciltīs, ko vada alfa tēviņš un kurām raksturīgas sarežģītas sociālās attiecības, līdzīgi kā ar cilvēkiem. Šajās šimpanžu sabiedrībās, tāpat kā daudzās citās, izvarošana un slepkavības ir ierasta parādība. Parastās šimpanzes ir daudz agresīvākas nekā Bonobos, un ir zināms, ka tās reizēm uzbrūk un nogalina cilvēkus. Tas nav īpaši grūti, ja cilvēks ir neapbruņots, jo šimpanzēm ir vairāk nekā 5 reizes lielāka ķermeņa augšdaļa nekā tipiska cilvēka tēviņam. Šīs šimpanzes ir visēdājas, un to uzturā ir ievērojams daudzums gaļas.
Atšķirībā no parastajām šimpanzēm Bonobo sugas šimpanzes pārsvarā ir veģetāras, nevardarbīgas, matriarhālas un ir slavenas ar savu seksuālo uzņēmību. Iemesls šai būtiskajai uzvedības atšķirībai nav pilnībā zināms. Bonobo šimpanzei ir proporcionāli garākas ekstremitātes nekā parastajai šimpanzei, un tās ir pielāgotas, lai vairāk laika pavadītu kokos, kur tās ēd augļus. Bonobos ir nedaudz vieglākas miesasbūves nekā parastajām šimpanzēm. Tas ir tāpēc, ka viņi ne medī, ne cīnās tik bieži kā parastās šimpanzes.
Abu sugu šimpanzes ir ļoti inteliģentas, viens no gudrākajiem dzīvniekiem bez cilvēkiem. Tāpat kā citi lielie pērtiķi (gorillas un orangutāni), šimpanzes ir rīku izmantotājas, kas spēj konstruēt savus elementārus rīkus un izmantot tos kulturāli specifiskos veidos. Pirms šimpanžu darbarīku izmantošanas atklāšanas tika uzskatīts, ka tikai cilvēki spēj izmantot instrumentus. Tāpat kā cilvēki, šimpanzes apzinās statusu un spēj manipulēt un maldināt. Viņi veic darbības gan lietderības, gan sociālās parādīšanas dēļ. Šimpanžu izziņas testi ir atklājuši, ka viņi var izmantot simbolus un saprast dažus valodas aspektus, tostarp relāciju sintaksi un skaitlisko secību jēdzienus.
Šimpanzes spēj izjust empātiju un var radīt smiekliem līdzīgus balsojumus, kas ir graujis Aristoteļa citātu, ka “smejas tikai dzīvnieks”. Šimpanzes ir viena no nedaudzajām sugām, kas spēj izturēt spoguļa pārbaudi, tas ir, atpazīst punktu uz pieres, skatoties spogulī. Tas tiek uzskatīts par svarīgu pašapziņas rādītāju.