Lai gan famotidīns un ranitidīns ir atšķirīgas molekulas, tiem ir tāda pati pamatdarbība organismā. Tie samazina skābes veidošanos šūnās, kas pārklāj kuņģi, traucējot specifiskiem receptoriem kuņģa šūnu ārpusē. Abas zāles ir piemērotas kuņģa čūlas, gastroezofageālās skābes refluksa slimības (GERD) un citu slimību, kas izraisa kuņģa skābes pārprodukciju, ārstēšanai, taču nepieciešamais daudzums un zāļu uzsūkšanās veids organismā ir atšķirīgs.
Famotidīns un ranitidīns ir daļa no zāļu grupas, ko sauc par histamīna H2 receptoru antagonistiem. Pārējie divi galvenie dalībnieki no 2011. gada ir cimetidīns un nizatidīns. Visas šīs zāles īpaši iedarbojas uz molekulu, ko sauc par H2 receptoru un kas izceļas no dažu šūnu ārpuses.
Kuņģa iekšpusē šūnas ar H2 receptoriem ārpusē, ko sauc par parietālajām šūnām, ir tās šūnas, kas ražo skābi kuņģa rajonā, kad signāli no citurienes norāda, ka ir nepieciešams vairāk skābes. Histamīns šajā gadījumā ir īpašā signāla molekula, un famotidīns un ranitidīns bloķē H2 receptorus no histamīna atpazīšanas. Šis darbības veids dod zāļu grupai to nosaukumu – histamīna H2 antagonisti.
Lai gan famotidīns un ranitidīns ir pilnīgi atšķirīgas molekulas, to darbība ir vienāda. Tie bloķē receptorus un neļauj ražot vairāk skābes, kas dod viņiem iespēju izmantot slimības, kas saistītas ar augstu kuņģa skābes līmeni. Piemēri ir GERD un ezofagīts, kas var izraisīt skābes bojājumus gremošanas sistēmas šūnās. Kuņģa un blakus esošās divpadsmitpirkstu zarnas čūlas var izzust arī ar histamīna H2 receptoru antagonistu ārstēšanu. Reģiona vēzi, kas rada pārāk daudz skābes, var arī atvieglot ar kādu no šīm zālēm.
Produktiem, kas satur famotidīnu, parasti ir jāsatur mazāk aktīvās sastāvdaļas nekā ranitidīna produktos ar parasto devu aptuveni 40 mg, salīdzinot ar ranitidīna devu 150 mg. Un otrādi, vairāk ranitidīna uzsūcas caur gremošanas traktu nekā famotidīns, taču tas var iedarboties ilgāk nekā famotidīns. Kā molekulai famotidīna ķīmiskā formula ir C8H15N7O2S3, turpretim ranitidīna vispārīgā formula ir C13H22N4O3S, un ūdeņraža un hlora atomu var pielīmēt, veidojot hidrohlorīda sāli. Abas molekulas atšķiras pēc struktūras, formas un masas, bet joprojām darbojas vienādi ar H2 receptoru. Cilvēki, kuri lieto vienu no šīm zālēm konkrētam stāvoklim, parasti nelieto otru vienlaikus.