Jūras biologa alga var būt atkarīga no specialitātes, atrašanās vietas un darba devēja, kā arī no pieredzes un kvalifikācijas. Par sākuma līmeņa amatiem cilvēkiem ar zemu kvalifikāciju ir tendence maksāt mazāk, atalgojuma skalai pieaugot, jo cilvēki iegūst pieredzi un papildu grādus vai sertifikātus. Karjerai šajā jomā var būt nepieciešami augstāki grādi ar septiņu vai vairāk gadu izglītību, kas ir ievērojams ieguldījums, pirms cilvēki sāk strādāt. Dažos gadījumos skolas laikā ir iespējams saglabāt sākuma līmeņa amatu, lai gan skolas beigšana var aizņemt ilgāku laiku.
Viens svarīgs faktors ir tas, uz ko koncentrējas jūras biologs. Ja priekšmets ir neskaidrs, jo īpaši tīrās pētniecības jomā, iespējams, ka nav pieejams ļoti daudz naudas, un jūras biologa alga var būt salīdzinoši zema. Turpretim interesējošās tēmas, īpaši lietas, kas ietekmē nozares, kuru pamatā ir jūras organismi, var maksāt labi. Piemēram, kāds, kurš koncentrējas uz zivsaimniecību, var nopelnīt vairāk nekā cilvēks, kurš pēta neskaidru zivi bez komerciālas vērtības.
Atrašanās vietai ir nozīme arī jūras biologa algā. Atalgojuma skalas dažādās valstīs var atšķirties, un tas, ko var uzskatīt par labu vai pieņemamu atalgojumu vienā vietā, nav citā vietā. Dzīves dārdzības atšķirības, iedzīvotājiem pieejamie sociālie pakalpojumi un citi faktori var ietekmēt to, cik daudz darba devējs ir gatavs piedāvāt. Cilvēki, kas strādā starptautiski, varētu vēlēties apsvērt šo jautājumu; darbs ārzemēs varētu sniegt interesantas iespējas, bet var nemaksāt tik labi, kā vēlas.
Darba devēja izvēle ir vēl viena būtiska ietekme uz jūras biologa algu. Privātās iestādes, īpaši tās, kuras darbojas rūpniecībā, mēdz maksāt vairāk. Valdības aģentūras var piedāvāt mazāku atalgojumu un dažreiz pieprasīt jūras biologiem rakstīt dotācijas, lai atbalstītu savu darbu, kas var patērēt vērtīgo pētniecības laiku. Akadēmiskajās iestādēs jūras biologa alga var atšķirties atkarībā no pieredzes un reputācijas. Cilvēkiem, kuri vēlas turpināt karjeru akadēmiskajās aprindās, jāsaņem publikāciju kredīti, lai uzlabotu savu pozīciju sarunās par atalgojumu.
Svarīgi ir arī akreditācijas dati, pieredze un reputācija. Personai, kurai ir augstāks grāds, dalība prestižās organizācijās un oficiāla atzinība par nopelniem, var būt tiesības uz lielāku atalgojumu, kā arī kādam, kam ir lielāka pieredze jūras bioloģijas kopienā. Cilvēki, kuri tiek uzskatīti par cienījamiem un uzticamiem pētniekiem, mēdz būt arī labāk atalgoti. Citiem jūras biologiem ir lielas algas, jo viņi ir popularizējuši šo jomu, izmantojot grāmatas, filmas un citus plašsaziņas līdzekļus, un tādējādi viņiem ir mājsaimniecības atzinība, kas liek iestādēm tos pieņemt darbā un maksāt par privilēģiju.