Parakstītā sertralīna deva lielā mērā ir atkarīga no ar to ārstētā stāvokļa, un devu var palielināt, ja zālēm nav būtiskas ietekmes. Tādiem stāvokļiem kā depresija, obsesīvi kompulsīvi traucējumi (OCD) un premenstruālie disforiski traucējumi ieteicama 50 miligramu (mg) deva, un, ja nepieciešams, tā jāpalielina ar 50 mg. Ja pacienti lieto sertalīnu panikas traucējumu vai pēctraumatiskā stresa traucējumu gadījumā, ieteicamā sākumdeva ir 25 mg dienā. Parasti dienā nedrīkst lietot vairāk par 200 mg.
Sertralīnu parasti izraksta depresijas ārstēšanai, un to klasificē kā selektīvu serotonīna atpakaļsaistes inhibitoru (SSAI) antidepresantu. Šīs zāles darbojas, lai palielinātu serotonīna daudzumu smadzenēs. Serotonīns ir neirotransmitera ķīmiska viela, kas ir atbildīga par signālu pārnešanu starp smadzeņu nerviem. Tiek uzskatīts, ka zems serotonīna līmenis smadzenēs ir saistīts ar tādiem stāvokļiem kā depresija, OKT, pēctraumatiskā stresa traucējumi un alkoholisms. Tāpēc SSAI var lietot šo stāvokļu ārstēšanai.
Ieteicamo sertralīna devu nosaka pacienta stāvoklis un viņa reakcija uz ārstēšanu. Pacientiem ar depresiju ieteicamā sākumdeva ir 50 mg. Šī ir visizplatītākā sertralīna lietošana, jo aptuveni viens no 10 cilvēkiem kādā dzīves posmā cieš no depresijas. Sertralīna deva OKT ārstēšanai ir arī 50 mg. OKT ir stāvoklis, kam raksturīgas piespiešanas sajūtas, kuras pacientam ir jāievēro, lai gan tās var būt neloģiskas vai nevajadzīgas. Abiem šiem stāvokļiem, ja sertralīna deva 50 mg dienā nepalīdz stāvoklim, to var palielināt par 50 mg katru nedēļu, maksimāli līdz 200 mg dienā.
Premenstruālie disforiski traucējumi ir smagāka premenstruālā sindroma versija, kad pacienti pirms menstruācijas jūtas nomākti, aizkaitināmi un saspringti. Sievietēm, kas cieš no šī stāvokļa, ieteicams lietot 50 mg dienā vai tikai menstruāciju luteālās fāzes laikā. Ja zāles lieto visu menstruālā cikla laikā, tās var izrakstīt tikai devā līdz 150 mg dienā. Ja to lieto tikai luteālās fāzes laikā, ieteicamā maksimālā sertralīna deva ir 100 mg.
Sociālās trauksmes traucējumiem un pēctraumatiskā stresa traucējumiem ieteicamā sākotnējā sertralīna deva ir 25 mg dienā. Ja pēc vienas nedēļas ārstēšana nav efektīva, to var palielināt līdz 50 mg. Pēc tam devu var palielināt tāpat kā citos apstākļos, palielinot par 50 mg reizi nedēļā, maksimāli līdz 200 mg dienā.