Ir burtiski desmitiem apdraudēto pērtiķu veidu, lai gan daudzi no tiem nav plaši pazīstami. No aptuveni 264 pērtiķu sugām, kas mūsdienās sastopamas savvaļā, aptuveni 52 ir atzīmētas kā apdraudētas vai kritiski apdraudētas Pasaules apdraudēto sugu sarakstā. Lai dzīvnieks tiktu apdraudēts, to skaitam ir jāsamazinās pietiekami strauji, lai draudētu izzušana.
Galvenais iemesls tik daudzu apdraudēto pērtiķu veidu iekļaušanai sarakstā ir tas, ka mednieki dažreiz ķer un nogalina šīs sugas gaļas vai kažokādas dēļ. Turklāt daudzus to biotopus iznīcina pieaugošā cilvēku populācija. Lai gan šī prakse daudzās jomās ir aizliegta, jo tiek uzskatīts, ka šiem dzīvniekiem draud izzušana, medības un ekspansija joprojām turpinās citās pasaules daļās. Citi pērtiķi ir apdraudēti slimību dēļ, jo daži pērtiķu veidi ir īpaši pakļauti vīrusiem un citām infekcijām.
Viens no apdraudēto pērtiķu veidiem ir garspalvainais zirnekļa pērtiķis. Šī ir viena no daudzajām zirnekļpērtiķu klasēm, kas ir iekļauta apdraudēto sugu sarakstā. Garspalvainam zirnekļpērtiķim ir slaidas rokas un kājas, kā arī gara aste, ko izmanto kāpšanai un balansēšanai kokos. Galvenie draudi tās dzīvotnei ir mežu iznīcināšana un gaļas medības. Citi apdraudēto pērtiķu veidi ir sarkanroku pērtiķu pērtiķis, Skletera Guenons, Muriki, brāļu Olalas titi pērtiķis un melnais vāveres pērtiķis.
Red Handed Howler Monkey dzimtene ir Brazīlija, un tas ir Jaunās pasaules pērtiķu veids, kas nozīmē, ka tam ir matains seja, gara aste un plaši novietotas nāsis.
Arī mariki, kas pazīstams arī kā melngalvas zirnekļa pērtiķis, ir no Brazīlijas. Sclater’s Guenon ir Vecās pasaules pērtiķu paveids, kas nozīmē, ka tam ir raksturīgas cieši novietotas nāsis un precīzāk pretstatīts īkšķis, līdzīgi kā cilvēkam. Ollalas brāļa titi mērkaķis ir vēl viens pērtiķu veids, kas ir viens no visvairāk apdraudētajiem, jo neapdzīvo aizsargājamo zemi.
Galvenie veidi, kā Pasaules savvaļas dzīvnieku federācija cenšas glābt daudzus apdraudētos pērtiķu veidus, ir aizsargāt to dzīvotnes ar likumu un izglītības palīdzību. Tā kā daudzas no šīm sugām lielākā daļa cilvēku nezina, ir svarīgi atbalstīt to izdzīvošanu, mācot par tām citus. Sazinoties ar dzīvniekiem un uzzinot, cik neparasts ir katrs radījums, cilvēki, visticamāk, palīdzēs saglabāt savu dzīvotni, piešķirot finansējumu pētniecības un dzīvnieku audzēšanas atbalstam nebrīvē.
Daudzus apdraudētos pērtiķu veidus audzē nebrīvē, cenšoties savvaļas dabas aizsardzības speciālistiem atgriezt to skaitu drošā diapazonā. Dažus no šiem dzīvniekiem, iespējams, varēs atgriezt savvaļā, lai gan daudziem nāksies pavadīt savu dzīvi zooloģiskajos dārzos un apdraudēto primātu patvērumos. Zoodārzu gadījumā tas arī ļauj plašākai sabiedrībai uzzināt vairāk par retām un lielākoties nezināmām pērtiķu sugām.