Pieaugot interesei par alternatīvām degvielām, piemēram, ģeotermālo enerģiju, ir svarīgi ņemt vērā arī ģeotermālās enerģijas trūkumus. Ģeotermālā enerģija izmanto zemē uzkrāto siltumu, lai ražotu elektroenerģiju. Šis siltums ir ieslodzīts zemes kodolā, un tam var piekļūt, veicot urbšanu zemes garozā. Ir vairākas vietas, kur enerģijas avots atrodas tuvāk zemes virsmai, ļaujot radīt siltumu, izmantojot jau izplūstošo tvaiku.
Ģeotermālajai enerģijai ir trīs galvenie trūkumi: atjaunojamība, infrastruktūras prasības un atrašanās vieta. Šie faktori ir galvenie ģeotermālās enerģijas izmantošanā visā pasaulē. Šāda veida enerģija nerada atkritumus un darbojas gandrīz bez maksas, tiklīdz ir pabeigti sākotnējie ieguldījumi rūpnīcā.
Zemes resursu aizplūšana ir viens no lielākajiem ģeotermālās enerģijas trūkumiem. Kad siltuma avots sāk atdzist, to vairs nevar mainīt. Lai gan šāda veida enerģijas iekārtas var nodrošināt stabilu enerģiju ilgāku laiku, ir noteikts beigu datums. Lai aizstātu šo enerģijas avotu, būtu jānosaka jauna vieta un jābūvē jauna iekārta.
Iekārtas, personāls, infrastruktūra un apmācība, kas nepieciešama ģeotermālās enerģijas stacijas izveidei, ir nozīmīgs gan naudas, gan aprīkojuma ieguldījums. Kad enerģija tiek izmantota no zemes, tā jāpārvērš elektrībā un jānogādā uz elektroenerģijas pārvades stacijām. Ir nepieciešams viss elektrības torņu, staciju un slēdžu tīkls, lai elektroenerģiju pārvietotu no ģeotermālās stacijas uz patērētāju.
Kvalificēts personāls ir jāpieņem darbā un jāpārvieto uz rūpnīcas atrašanās vietu. Ideāla vieta ģeotermālās enerģijas stacijai ir diezgan attāla, kas palielina projekta izmaksas. Ir nepieciešami resursi un telpas liela personāla izmitināšanai un atbalstam. Daudzi uzņēmumi piedāvā papildu prēmijas, lai mudinātu darbiniekus pārcelties uz šīm attālajām vietām.
Ir veikts daudz pētījumu par ģeotermālās enerģijas stacijas ietekmi uz vidi un ģeotermālās enerģijas trūkumiem. Enerģija un siltums, kas rodas zemes kodolā, rada lavu un spiežas pret zemes garozu. Šis process veido zemes masu un nostiprina zemes garozu. Piekļuve zemes enerģijai un tās izmantošana kā enerģijas avots var ietekmēt zemes stabilitāti un tektoniskās plāksnes, kas veido zemes virsmas pamatstruktūru.
Ir nepieciešama turpmāka ģeotermālās enerģijas risku un ieguvumu izpēte, pirms to var izmantot kā uzticamu enerģijas avotu visā pasaulē. Tā kā citi enerģijas avoti ir izsmelti, šim enerģijas veidam tiks pievērsta lielāka uzmanība. Turpinās darbs, lai samazinātu kopējās izmaksas, kas saistītas ar enerģijas veidu.