Anaģenēze ir evolūcijas veids, kurā suga kopumā laika gaitā būtiski mainās, tā ka senču suga faktiski ir izmirusi. Tas ir tas, ko daudzi cilvēki domā, atsaucoties uz evolūcijas procesu, jo veselas sugu paaudzes attīstās un laika gaitā mainās, lai pielāgotos vides vajadzībām vai iegūtu jaunas iezīmes. Kad notiek šīs izmaiņas, iepriekšējās sugas vienkārši beidz pastāvēt, jo izmaiņas notiek veselu paaudžu garumā, nevis tikai izolētās sugas populācijas kabatās. Anaģenēze ir pretstatā kladoģenēzei, kas ir evolūcijas veids, kurā daļa sugas mainās, lai kļūtu par jaunu sugu.
Saukta arī par filētisko evolūciju vai izmaiņām, anagenēze ir evolūcijas forma, kas notiek, kad viena vesela suga pārvēršas citā. Tā kā, piemēram, cilvēce ir attīstījusies no primātiem, katra suga ir mainījusies un pielāgojusies dažādām vajadzībām, lai kļūtu par jaunu sugu. Pašlaik pastāvošais Homo sapiens, iespējams, cēlies no Homo erectus, bet evolūcijas process notika visai sugai, atstājot Homo erectus izmiršanu. Šo pašu anaģenēzes procesu var novērot citos dzīvniekos, kuros senās sugas ir kļuvušas par jaunākām sugām un faktiski izzudušas.
Anaģenēzes nozīme ir tajā, ka to var izmantot, lai saprastu, kā sugas attīstās kopumā un kāpēc dažas sugas izmirst. Šādas evolūcijas izmaiņas notiek dažādos veidos, taču tās neaprobežojas tikai ar sugas populācijas kabatām. Vizuāli dokumentējot, anaģenēze parasti izpaužas kā viena līnija ar slīpumu, kas parāda sugas izmaiņas laika gaitā. Tas ir pretstatā kladoģenēzei, kas bieži tiek attēlota grafiskā formā kā līnija, kas sazarojas, veidojot jaunas līnijas.
Kladoģenēze, atšķirībā no anaģenēzes, ir evolūcijas process, kurā mainās un attīstās kāda populācijas daļa, bet ne visa suga vai paaudze. Tas atstāj sākotnējās sugas vairāk vai mazāk neskartas, ļaujot līdzāspastāvēt gan vecākajām sugām, gan jaunajām sugām. Evolūcijas tests no vienas sugas par patiesi jaunu un unikālu sugu parasti ir tas, vai abas sugas var pāroties viena ar otru. Kladoģenēzē iegūtās sugas joprojām nevar vairoties ar sākotnējām sugām; anaģenēze nav pakļauta šim testam, jo iepriekšējā suga evolūcijas periodā ir izmirusi.