Aptiekas loma veselības aprūpē ir kontrolēt zāļu pieejamību, izsniegt zāles un nodrošināt, ka tiek ievēroti zāļu drošības pasākumi pacientiem. Tradicionāli farmaceits zāles atrada, saskaitīja un iepako bez automātisko sistēmu palīdzības. Tehnoloģiskie sasniegumi un sistēmas ir pieejamas arī aptiekai, kas var pārņemt dažas lomas no farmaceita. Aptieku automatizācija potenciāli var samazināt cilvēku kļūdas un saglabāt krājumu kontroli, taču robotizēto sistēmu uzstādīšana un uzturēšana var būt dārga.
Katrā aptiekā zāles parasti tiek stingri kontrolētas. Aptiekas darbinieki uztur medikamentus sakārtotus un uzkrājumus, ko var veikt arī aptiekas automatizācijas sistēma. Iekārta var uzskaitīt krājumus, kā arī informāciju, piemēram, zāļu derīguma termiņu. Izmantojot aptieku automatizāciju, krājumus var arī turēt droši aizslēgtus, lai tiem varētu piekļūt tikai apstiprināti darbinieki, kā arī var uzraudzīt izņemšanu. Dažkārt farmaceitam nākas izskaitīt tabletes, taču šo laikietilpīgo darbu varētu aizstāt ar automātisko tablešu skaitītāju, kas pirmo reizi atrada vietu aptiekās 1970. gados kā sarežģītākas aptieku automatizācijas priekštecis.
Kļūdas medikamentu lietošanā ir būtisks risks, ar ko saskaras aptiekas, jo farmaceits var kļūt par upuri cilvēka kļūdām. Tomēr, izmantojot aptieku automatizācijas sistēmas, var samazināt nepareizu recepšu skaitu. Tā vietā, lai cilvēks sajauktu vienu medikamentu ar citām zālēm ar līdzīgu nosaukumu, iekārta var nolasīt produkta svītrkodu un parādīt informāciju ekrānā. Ja ārsta receptē ir arī svītrkods, iekārta var salīdzināt abus, lai iegūtu papildu precizitāti.
Arī ar roku izrakstītās receptes var būt nesalasāmas, kas rada vēl vienu apdraudējumu pacientam, ja farmaceits izraksta nepareizās zāles. Izmantojot aptieku automatizācijas sistēmu, kas aptver gan ārsta kabinetu, gan aptieku, var novērst šo problēmu. Aptieku automatizācijas sistēmas iespējamās funkcijas ietver iespēju farmaceitam vajadzības gadījumā piekļūt plašākai informācijai, nekā norādīts produkta iespiedumā.
Ja slimnīcā vai klīnikā ir aptieku automatizācijas sistēma, tā var samazināt kļūdas un novērst pacientu bīstamu medikamentu saņemšanu. Pacientam var būt automatizēta viņa vai viņas slimības diagramma un medikamenti, kas ir piemēroti šim stāvoklim, kā arī to medikamentu saraksts, kas nav piemēroti. Pēc tam medmāsa varētu skenēt personas diagrammu, lai iegūtu atbilstošās zāles, un pārliecinātos, ka nejauši netiek parakstītas neatbilstošas zāles.
Automātiskās sistēmas trūkumi ietver iekārtu izmaksas, lai gan izmaksas var kompensēt, samazinot narkotiku kontrolei un izsniegšanai nepieciešamā personāla skaitu. Turklāt automātiskās sistēmas var sabojāties, vai arī cilvēki var tās apiet un samazināt to efektivitāti, pārkāpjot lietošanas noteikumus. Piemēri ir citas personas identifikācijas izmantošana vai pacienta recepšu sajaukšana.