Etanola biomasa ir organisks materiāls, kas piemērots etanola ražošanai. Kukurūza ir ievērojams un plaši izmantots piemērs tam, taču citi avoti var būt aļģes, sārta zāle un citas celulozes kultūras. Biomasas iegūšana rada bažas dažiem etanola ražotājiem, jo tiem ir nepieciešama piekļuve materiāliem, kas ir enerģētiski blīvi un kurus var efektīvi pārvērst etanolā. Dažās aprindās biomasas ieguve ir strīdīgu diskusiju priekšmets.
Termins “biomasa” plašākā nozīmē attiecas uz organiskiem materiāliem, klasiski atkritumiem, kurus nevar ēst vai izmantot rūpnieciskos procesos. Šis termins tiek lietots arī ekoloģijā, lai runātu par kopējo augu materiālu noteiktā apgabalā, jo bažas rada biomasa, kā arī bioloģiskā daudzveidība. Etanola biomasu faktiski var izmantot rūpnieciskos procesos, un daži biomasas avoti faktiski ir arī pārtikas avoti.
Lai ražotu etanolu, biomasa ir jāpārveido tā, lai tās enerģija būtu pieejama kurināmā veidā, ko cilvēki varētu izmantot. Etanola ražošana balstās uz etanola biomasas izmantošanu, kuras audzēšanai un pārveidošanai nepieciešams mazāk enerģijas, nekā tā ražo. Pretējā gadījumā process būtu neefektīvs, padarot etanolu par sliktu alternatīvās degvielas izvēli. Tādas kultūras kā sārta zāle ir piemērotas, jo to audzēšanai nepieciešams daudz mazāk enerģijas, un tehnoloģija etanola biomasas attīrīšanai, lai to pārvērstu etanolā, visu laiku uzlabojas, palielinot etanola ekstrakcijas efektivitāti.
Daži cilvēki ir ierosinājuši, ka, apstrādājot pārtikas kultūras, piemēram, kukurūzu, par etanola biomasu, etanola rūpniecība varētu apdraudēt pārtikas piegādes stabilitāti, jo lauksaimnieki varētu vairāk stādīt pārtikas kultūras izmantošanai etanola ražošanā. Nepārtikas kultūras, ko izmanto kā etanola biomasu, teorētiski varētu arī aizstāt pārtikas kultūras, samazinot tirgū pieejamo pārtiku. Tomēr etanola aizstāvji uzskata, ka no šādas nelīdzsvarotības var izvairīties ar pārdomātu zemes apsaimniekošanu un ka etanola biomasas ražošanai nav jāietekmē pārtikas ražošana.
Sekundāra problēma ar etanola enerģiju ir tā, ka daudzas valdības ļoti subsidē etanola biomasas ražošanu. Kritiķi norāda, ka subsīdijas ir veicinājušas mākslīgu tirgu un ka subsīdiju atcelšana ļautu cilvēkiem redzēt, vai etanolam patiešām ir tirgus. Advokāti norāda, ka līdzīgas subsīdijas ir paredzētas daudzām kultūraugiem un nozarēm un ka dažreiz subsīdijas ir nepieciešamas, lai atbalstītu topošo nozari, līdz tā var sasniegt neatkarību. Saskaņā ar šo teoriju nepieciešamība pēc subsīdijām pakāpeniski samazinātos, palielinoties etanola ražošanai un pieprasījumam pēc etanola.