Antibiotiku ražošanā iesaistītās procedūras ir atkarīgas no tā, vai produkts ir dabisks, daļēji sintētisks vai pilnībā sintētisks. Dabiskās zāles tiek ražotas, kultivējot mikroorganismus kontrolētos apstākļos un savācot savienojumus, ko tie izsaka, savukārt daļēji sintētiskie produkti ietver papildu darbību, lai modificētu dabiski ražotas ķīmiskas vielas. Sintētika, tāpat kā sulfa zāles, tiek ražota ķīmiskā ražošanas procesā. Antibiotiku ražošanai visos gadījumos ir nepieciešama sterila vide ar pastāvīgu uzraudzību, lai pārbaudītu, vai nav piesārņojuma pazīmes, kas varētu traucēt drošu zāļu ražošanu.
Dabīgām antibiotikām ir jāsagatavo mikroorganismu, piemēram, sēnīšu, kultūra, kas izsaka antibiotikas kā blakusproduktu. Tos audzē lielās fermentācijas tvertnēs ar pārtiku, lai tie varētu vairoties. Mikrobiologs uzrauga procesu, kontrolējot temperatūru, mitrumu un citus apstākļus, lai palielinātu ražu. Var paiet vairākas dienas, lai pagatavotu antibiotiku buljonu, kas jāizlaiž cauri filtrēšanas sistēmām, lai attīrītu un ekstrahētu zāles. Pārbaudes nodrošina darbiniekiem, ka antibiotiku ražošana nav bijusi piesārņota un zāles ir pietiekami spēcīgas, lai tās pārdotu sabiedrībai.
Daļēji sintētiskās narkotikas to papildina. Tā vietā, lai attīrītu un iepakotu dabisko produktu, ražotnes darbinieki to apstrādā ar ķīmisku procesu. Šis antibiotiku ražošanas posms maina zāļu struktūru. Tas nav pilnībā sintētisks, jo tā pamatā ir dabisks produkts, taču tas nav tas pats produkts, kas varētu būt sastopams savvaļā. Šīs zāles var būt virulentākas pret plašāku organismu klāstu vai tām var būt mazāk blakusparādību nekā to dabiskajām formām. Ampicilīns ir daļēji sintētiskas antibiotikas piemērs.
Sintētiskās narkotikas tiek ražotas ar ķīmiskām reakcijām, sākot ar izejvielu, kas tiek modificēta kontrolētā vidē. Antibiotiku ražošanu, izmantojot sintētiskos procesus, var būt vieglāk kontrolēt, jo tā nav pakļauta fermentācijas tvertnēs izmantoto dzīvo organismu dabiskajām variācijām. Joprojām ir nepieciešama rūpīga uzraudzība, lai pārbaudītu piesārņojumu un ražotu tīras un standarta koncentrācijas zāles.
Tāpat kā citu farmaceitisko līdzekļu gadījumā, arī antibiotiku ražošanu regulē valdība. Aģentūras var pārbaudīt ražošanas iekārtas un produktu partijas, kurām ir tiesības atsaukt zāles, ja ir bažas par drošību vai iedarbīgumu. Viņi var arī pieprasīt žurnālus, kuros dokumentētas testēšanas un kvalitātes kontroles procedūras, lai apstiprinātu, ka uzņēmumam ir skaidri iekšējie standarti un tas vienmēr tiek ievērots.