Japāņu ūdens dārzs tiek uzskatīts par lielisku mākslas darbu, kas ir jāizstrādā un jākopj ar meditatīvu izsmalcinātību. Japāņu dārzi ir izstrādāti un nodoti no meistara jeb senseja uz mācekli. Senā, kultivētā Japānas ainava atspoguļoja japāņu kultūru un filozofiju: harmonija ar dabu, miers, nopietnas pārdomas un disciplīna. Japāņu ūdens dārzs ir mazāks, spilgts elements, kas iekļauts lielākā tipiskā japāņu dārzā, un tas ietver ūdeni; rotājumi, piemēram, tilts, atspēriena akmeņi vai laterna; paviljons vai pagoda; un vietējie augi.
Senā japāņu dārzu slepenā grāmata jeb Sakutei-ki, kas sarakstīta 11. gadsimtā, ir vecākā zināmā dārzkopības mākslas grāmata pasaulē. Tajā autors izklāsta striktus noteikumus un atbilstošus aizstājējus izteikti simboliskajam japāņu dārzam. Piemēram, grāmata nosaka ūdenskritumu veidu, izmēru un akmeņus, kā arī teikts, ka “deviņi vītoli var aizstāt upi”, kur nav ūdens. Kad 19. gadsimta beigās japāņu dārzi kļuva popularizēti rietumu kultūrās, noteikumi tika izmainīti, lai pielāgotos dažādajiem klimatiskajiem apstākļiem un piemājas dārzkopības rietumu gaumei.
Ūdens, neatkarīgi no tā, vai tas ir īsts vai simbolisks, acīmredzami ir Japānas ūdens dārza galvenā sastāvdaļa un galvenais fokusa punkts. Japāņu ūdensdārzi mēģina pielāgoties esošās ūdens apgādes dabiskajai gaitai vai nodrošināt dabisku plūsmu, ja nepieciešams imitēts ūdens. Dīķi un strauti plūst maigi, nevis ģeometriskās līnijās. Priekšroka tiek dota dabīgiem ūdenskritumiem vai maigām upītēm, nevis mākslīgām strūklakām. Vietās, kur nav pieejams ūdens, viegli izliekti smilšu vai noapaļotu oļu celiņi var liecināt par tā klātbūtni.
Turpinot tēmu par harmoniju ar dabu, japāņu ūdensdārza flora ir iedzimta klimatam un piemērota ūdeņainai videi. Japāņu ūdensdārzos puķes audzē reti. Tie kalpo tikai kā komplimenti sulīgajam zaļumam un burbuļojošajam ūdenim.
Dabiski rotājumi izdaiļo dārzu, bet nekad nenomāc dārzu. Japāņu ūdensdārza centrālais punkts ir ūdens, un tādi rotājumi kā atspēriena akmeņi, tilts un laterna kalpo, lai palielinātu ūdens nozīmi. Pagoda vai paviljons aicina apmeklētāju uzkavēties klusās pārdomās, iespējams, oficiālas tējas ceremonijas laikā. Visi elementi japāņu ūdens dārzā virza dārznieku un apmeklētāju baudīt dabas mieru.