Mikrofotogrāfs ir fotoattēls ar kaut ko, kas tiek palielināts un uzņemts caur mikroskopu. Kopš fotografēšanas sākuma cilvēki ir mēģinājuši radīt fotogrāfiskus attēlus no lietām, ko viņi skatās caur mikroskopiem, ar dažādu panākumu pakāpi. Uzņemot mikrofotogrāfiju, lai iegūtu labas kvalitātes attēlu, ir jāpārvar vairākas problēmas.
Viena pieeja mikrofotografēšanai ir kameras piestiprināšana mikroskopa okulāram. Paraugu ievieto mikroskopā, mikroskopu noregulē un fokusē, pēc tam tiek fokusēta kamera un uzņemta fotogrāfija. Cits paņēmiens ietver specializēta mikroskopa izmantošanu ar iebūvētu kameru, ko var izmantot, lai uzņemtu nekustīgus vai video attēlus no objektiem uz mikroskopa skatuves.
Lai iegūtu labu mikrofotogrāfiju, ir nepieciešams ļoti smalks fokuss un kameras objektīvs, kas spēj fokusēties mikroskopa apstākļos. Arī gaisma parasti ir kritiska problēma, jo skaidram attēlam ir nepieciešams pietiekami daudz gaismas, neizskalojot objektu uz mikroskopa skatuves vai nesabojājot to ar gaismu. Process var kļūt vēl sarežģītāks, ja kādam ir jānofotografē kaut kas, piemēram, paraugs, kas jāskatās melnā gaismā, lai izceltu traipu vai citu objektu.
Papildus fotografēšanai ar parasto mikroskopu, fotogrāfijas var uzņemt arī ar elektronu mikroskopu. Elektronu mikrofotogrāfijas var būt ļoti detalizētas un bagātīgas, uzrādot augstu palielinājuma līmeni un atklājot struktūras, kuras parastā mikroskopā var nebūt viegli saskatāmas. Elektronu mikroskopa izšķirtspējas spējas ir daudz lielākas nekā parastajam gaismas mikroskopam, un to var skaidri ilustrēt, aplūkojot viena un tā paša objekta mikroskopiskās fotogrāfijas, kas aplūkotas gaismas mikroskopijā un pēc tam elektronu mikroskopijā.
Daudzi cilvēki ir redzējuši mikrofotogrāfiju, pat ja viņi to neapzinās. Bioloģijas mācību grāmatās parasti ir vairāki piemēri, un attēlu meklēšana jebkurā meklētājprogrammā “fotomikrogrāfs” var iegūt skaistus, spocīgus un pārsteidzošus attēlus. Mikroskopijā tik parasts objekts kā ziedputekšņu grauds var kļūt neparasts.
Papildus tam, ka fotomikrogrāfijas tiek izmantotas zinātnes mācību grāmatu ilustrēšanai un cilvēku aizraušanai par zinātni, tās tiek izmantotas arī patoloģijā, lai izveidotu šūnu attēlus papildu uzziņai, kā arī tādās jomās kā tiesu zinātne un vispārējā bioloģija, kā arī daudzās citās vietās. Mikrofotogrāfijas parasti tiek pievienotas zinātniskām publikācijām, kas var būt gan jauna vīrusa atklāšana, gan augu šūnu iekšējās darbības pētījumi.