Kas ir RNS sekvencēšana?

Zinātnieki sekvencē dezoksiribonukleīnskābi jeb DNS daudz biežāk nekā RNS. DNS līdzīgi veido nukleotīdi, taču tie ir sakārtoti dubultā spirālē. RNS “transkripti” faktiski tiek veidoti, pamatojoties uz nukleotīdu secību DNS virknē — DNS mēdz būt izturīgāka nekā RNS, jo daudzas RNS virknes ir jāveido no vienas DNS sekvences. Turklāt DNS satur “intronus” jeb nekodējošus DNS segmentus, kas tiek rediģēti transkripcijas procesa laikā un tāpēc netiek atklāti ar RNS sekvencēšanu. RNS sekvencēšana joprojām ir svarīga, lai gan daudzos gadījumos pirms sekvencēšanas ir nepieciešams RNS “reversā transkribēt” atpakaļ uz DNS.

Fakts, ka RNS sekvence ne vienmēr ir tāda pati kā DNS secība, no kuras tā tika pārrakstīta, ir viens no galvenajiem iemesliem, kāpēc zinātnieki faktiski veic RNS sekvencēšanas eksperimentus. RNS sekvencēšana ļauj zinātniekiem atklāt, kuras DNS veidnes daļas tika rediģētas transkripcijas laikā. Zinot to, viņi var pārbaudīt, kā un kāpēc secība tika rediģēta. Viena no interesantajām problēmām bioloģijā ir fakts, ka liela daļa genoma jeb ģenētiskās informācijas summēšanas organismā šķiet neizmantota. Precīzi uzzināt, kuras sekvences tiek izmantotas un kuras nav, ir svarīgs solis, lai izpētītu šo neizmantoto ģenētiskās informācijas segmentu sarežģītību.

Daudzu biotehnoloģiju pētnieku uzmanības centrā ir efektīvāku un efektīvāku RNS sekvencēšanas metožu izstrāde. Pirms secības iegūšanas pētniekiem parasti ir jātranskribē RNS uz DNS. Pētnieki vēlas izstrādāt metodes, kas ļauj efektīvi veikt tiešu RNS sekvencēšanu, nesabojājot RNS virknes. Turklāt pētnieki vēlas atrast augstas caurlaidspējas metodes, kas ļauj viņiem secināt daudzas RNS virknes viena RNS sekvencēšanas procesa laikā.