Kas ir ribosomu RNS sekvencēšana?

Neatkarīgi no tā, vai to izmanto baktēriju vai sarežģītāku organismu ribosomām, ribosomu RNS sekvencēšana tiek veikta līdzīgā veidā. Kad RNS ir atdalīta no ribosomas, tā tiek dublēta daudzas reizes, pēc tam sadalīta mazos fragmentos, kuru sekvences var viegli identificēt. Pēc tam šīs mazās secības daļas tiek atkārtoti saliktas, lai ģenerētu tikko noteikto secību. Uzdevums kļūst sarežģītāks, jo secība kļūst garāka, taču process joprojām ir salīdzinoši viegls attiecībā uz ribosomu RNS, kas ir salīdzinoši maza. Nav garantijas, ka pirmais mēģinājums veikt ribosomu RNS sekvencēšanu būs pareizs pirmajā reizē, tāpēc parasti tiek veikti vairāki mēģinājumi pārbaudīt datu kvalitāti.

Datus, kas iegūti no ribosomu RNS sekvencēšanas, var izmantot dažādiem mērķiem, bet viens no visizplatītākajiem ir baktēriju identifikācija. Jo īpaši baktēriju ribosomu RNS ir ļoti konservēta starp sugām, tāpēc sekvencēšana ļauj sugas unikālās īpašības konsolidēt profilā atsaucei. Šo profilu var izmantot, lai ātri un viegli identificētu konkrētu baktēriju veidu, testu, kas var palīdzēt diagnosticēt un ārstēt slimos. Līdz ar labāku sekvencēšanas tehnoloģiju parādīšanos šī pieeja ir kļuvusi biežāka diagnozēs.

Otra ietekme, ko ribosomu RNS sekvencēšana var atstāt uz cilvēka veselību, ir zāļu un zāļu izstrāde. Baktēriju ribosomu RNS sekvencēm ir daudzas apakšsekvences, kas raksturīgas tikai baktērijām, tāpēc pretmikrobu zāļu mērķēšana uz šiem reģioniem var iznīcināt baktērijas, nenodarot kaitējumu cilvēkiem. Ribosomu RNS sekvencēšanas dati paši par sevi nesniedz pietiekami daudz datu, lai radītu zāles, taču tie ļauj zinātniekiem koncentrēties uz turpmākajiem pētījumiem un zāļu izstrādi. Var izveidot zāļu molekulas, kas pievienojas sekvencēm un atspējo ribosomu. Daudzas pašreizējās zāles izmanto šo metodi, lai cīnītos pret slimībām.