Kas ir RNS analīze?

Viens no visizplatītākajiem un pamata RNS analīzes veidiem ir secību analīze. RNS sastāv no četru veidu molekulām, kas pazīstamas kā nukleotīdi: adenīns, guanīns, citozīns un uracils. Nukleotīdu secības noteikšana šādās RNS ķēdēs ļauj pētniekiem paredzēt iegūtā proteīna struktūru vai meklēt mutācijas secībā. Sekvences analīzi var izmantot arī, lai prognozētu RNS ķēžu struktūras, kas funkcionē pašas par sevi un netiek pārvērstas olbaltumvielās.

Vēl viena salīdzinoši izplatīta RNS analīzes forma ir strukturālā analīze, kuras mērķis ir noteikt noteiktas RNS ķēdes sekundāro struktūru. RNS ķēžu funkcijas, kas netiek pārvērstas olbaltumvielās, izriet no to trīsdimensiju struktūrām, kuras parasti sauc par sekundārajām struktūrām. Izpratne par RNS ķēdes sekundāro struktūru, izmantojot strukturālo RNS analīzi, var palīdzēt pētniekiem labāk izprast mehānismus, caur kuriem RNS ķēde darbojas. Strukturālo RNS analīzi var veikt, izmantojot datorizētas prognozes, kuru pamatā ir RNS sekvencēšana, un ar dažādām eksperimentālām metodēm.

RNS var veikt dažādas funkcijas, ne tikai kodējot olbaltumvielas vai pildot ierobežotas funkcijas organismā. Dažas no šīm funkcijām ir acīmredzamas dažu veidu vīrusos, kuriem ir RNS genomi, kas nozīmē, ka visa to ģenētiskā informācija tiek glabāta kā RNS. Šādi vīrusi iebrūk saimniekšūnās un replikējas ar proteīnu palīdzību, ko var izstrādāt no RNS genoma. Citi vīrusu veidi izmanto procesu, kas pazīstams kā reversā transkripcija, lai iegūtu DNS no RNS. RNS analīze var ļaut pētniekiem zināmā mērā noteikt, kā šie vīrusi darbojas, un izstrādāt iespējamos veidus, kā tos neitralizēt.