Rūpnieciskā raudzēšana ir tas pats process, ko izmanto mājsaimniecības maiznieki, uzklājot uz maizes raugu, taču daudz plašākā mērogā. Šī procedūra fermentē noteiktus materiālus noderīgos produktos, izmantojot mikroorganismus, oglekli, slāpekli, skābekli un enerģijas avotu fermentācijas darbināšanai. To parasti veic pārtikas produktiem, bet rūpniecisko fermentāciju veic arī farmācijas rūpniecībā un notekūdeņu apglabāšanā. Lielākā atšķirība starp parasto fermentāciju un rūpniecisko šķirni ir tā, ka liela mēroga fermentācijas ražošanai tiek izmantotas lielas fermentācijas iekārtas.
Fermentācija neatkarīgi no tā, vai tā ir mājsaimniecības vai rūpnieciska fermentācija, ir organisko savienojumu oksidēšanas darbība, lai iegūtu jaunu sastāvdaļu. Lai radītu šo efektu, ir jābūt vairākiem dabiskiem elementiem. Fermentācijai nepieciešams oglekļa avots, piemēram, cukurs; slāpekļa avots, piemēram, olbaltumvielas vai nitrāti; skābeklis; un enerģijas avots, piemēram, siltums vai spiediens. Kad tie apvienojas, dabiskais fermentācijas process sadala materiālu sastāvdaļas un pārvērš tos par kaut ko noderīgu.
Rūpnieciskā fermentācija pārtikai ir viens no acīmredzamākajiem fermentācijas izmantošanas veidiem. Visiem spirtiem ir nepieciešama fermentācija, lai spirts attīstītos. Siers prasa, lai piena produkti būtu izturēti un raudzēti, pirms tie iegūst siera īpašības. Ir arī daudzi cepšanas pielietojumi, piemēram, lielāko daļu maizes, kurām arī nepieciešama raudzēšana.
Farmācijas rūpniecībai ir nepieciešama fermentācija, lai radītu daudzas zāles. Piemēram, visām antibiotikām, kuru pamatā ir penicilīns, ir nepieciešama penicilīna fermentācija, lai antibiotika būtu efektīva. Tas pats attiecas uz mākslīgiem hormoniem, piemēram, insulīnu un medicīniskajiem steroīdiem, kā arī vitamīniem un aminoskābēm olbaltumvielu batoniņos.
Notekūdeņu apglabāšanā tiek izmantota rūpnieciskā fermentācija, sadalot cietos notekūdeņus nekaitīgos materiālos, kurus var izmantot kā mēslojumu. Baktērijas nonāk notekūdeņos un sāk tos apēst, līdz notekūdeņi ir šķīstoši un nekaitīgi. Lai arī notekūdeņu fermentācija ir efektīva, tā prasa ilgu laiku.
Salīdzinot rūpniecisko fermentāciju ar citiem fermentācijas veidiem, atšķirības ir ļoti mazas, jo abos izmanto vienus un tos pašus bioloģiskos procesus. Visbiežāk rūpnieciskā mēroga fermentācijai tiek izmantota iekārta, ko sauc par fermentatoru, kas ir pietiekami liela, lai tajā ievietotu lielu daudzumu sastāvdaļu. Šīs iekārtas ir izgatavotas, lai uzturētu materiālus pareizos apstākļos, lai nodrošinātu nepārtrauktu fermentāciju. Fermentatorus visbiežāk izmanto ar farmaceitisko raudzēšanu, bet arī cepšanas fermentācija izmanto iekārtas.