Salīdzinošā fizioloģija ir zinātnes nozare, kas pēta līdzības un atšķirības starp dzīvajām būtnēm un to darbību. Salīdzinošā fizioloģija kā pētniecības joma ir fizioloģijas apakšklase: dzīvo organismu funkcionālo procesu izpēte. Pati disciplīna ietver daudzas atšķirīgas zinātnes arēnas, tostarp evolūciju, vides pētījumus un arheoloģiju.
Nepieciešamības un zinātkāres kombinācija radīja salīdzinošo fizioloģiju. Ārstiem bija vajadzīgi jauni paņēmieni cilvēku pacientu ārstēšanai, tāpēc dzīvnieki, kuriem ir līdzīgas īpašības kā cilvēkiem, bija piemērota vieta pētījumiem. Tādējādi radās Kroga princips, kas nosaka viegli pieejamu dzīvo būtņu izmantošanu, lai atbildētu uz zinātniskiem vai medicīniskiem jautājumiem. Galu galā šī praktiskā izmantošana salīdzināšanai kļuva par vispārēju zinātnisku zinātkāri par dažādu dzīvnieku sugu līdzībām un atšķirībām.
Salīdzinošie fiziologi pēta un salīdzina plašu organismu funkciju klāstu. Gandrīz jebkura organisma ķermeņa daļa ir svarīga, un gandrīz visiem dzīviem organismiem ir kopīgas pamatvajadzības, piemēram, pārtika, elpošana, iekšējās temperatūras kontrole un sirds uzturēšana. Pētot procesus, kas virza šīs vajadzības, piemēram, šūnu apmaiņu un asinsriti, pētnieki var savākt milzīgu daudzumu salīdzinošās informācijas.
Savā ziņā attiecības nosaka salīdzinošo fizioloģiju. Visvienkāršākajā līmenī šī joma ir pētījums par attiecībām starp dzīvu radību un savu ķermeni. Pareizus salīdzinājumus var panākt tikai tad, ja zinātnieks saprot, kā katra organisma fiziskais ķermenis ļauj veikt ikdienas dzīvei nepieciešamās darbības. Tāpēc salīdzinošās fizioloģijas fizioloģiskā sastāvdaļa var būt no izpētes, kā organismi izmanto ekstremitātes vai citus piedēkļus, lai pārvietotos, līdz tam, kā organismi elpo.
Vēl viens svarīgs salīdzinošās fizioloģijas aspekts ir attiecības starp organismiem un to vidi jeb ekofizioloģija. Vienam un tam pašam fiziskajam iestatījumam var būt ļoti atšķirīga ietekme uz atšķirīgiem organismiem. Piemēram, zivs iznākums tuksnešainā vidē būs daudz drūmāks nekā tās mājas ūdens vidē. Turpretim sauszemes ķirzaka, kas ir pieradusi pie skarbākā klimata, tās anatomiskās uzbūves dēļ nebūtu pietiekami aprīkota, lai tiktu galā ar ūdens vidi. Tādējādi ekofizioloģija un tās adaptācijas aspektu izpēte var piedāvāt labāku izpratni par visām dzīvnieku grupām salīdzinošajā fizioloģijā.
Vienai konkrētai salīdzinošās fizioloģijas jomai laika gaitā ir pievērsta pastiprināta uzmanība: filogēno salīdzinošo metožu izmantošanai. Zinātnieki izmanto šīs metodes, lai pārbaudītu iespējamās evolūcijas attiecības starp dažādiem dzīviem organismiem un dokumentētu visas nozīmīgas izmaiņas, kas konkrētai dzīvnieku grupai var būt notikušas kopš tās izveidošanas. Pētnieki var pētīt fiziskās līdzības starp noteiktiem organismiem vai to, kā daži organismi ir attīstījuši līdzīgas funkcionālās daļas, piemēram, plaušas vai žaunas elpošanas nolūkos. Rezultātā pētījums var atklāt dažādu sugu kopīgus senčus un nostiprināt evolūcijas saikni. Fosilo atlieku un citu arheoloģisko pierādījumu izpēte var arī palīdzēt salīdzinošajiem fiziologiem saprast, kā dzīvnieku grupa ir mainījusies un pielāgojusies no seniem laikiem līdz mūsdienām.