Zimogrāfija ir bioķīmiķu veikta metode, kurā daļiņas tiek izkliedētas, izmantojot elektrisko lādiņu procesā, kas pazīstams kā elektroforēze. Konkrēti, procesā tiek izmantots substrāts, kurā ferments polimerizācijas ceļā reaģēs ar polikrilamīda gēlu, ūdens bāzes šķīdumu, kas izgatavots no toksiskiem materiāliem. Šis zimogrammas gēls ir pazīstams kā nātrija dodecilsulfāta poliakrilamīda gēls (SDS-PAGE).
Bioķīmiķis, kurš veic zimogrāfiju, sagatavos zimogrammas želeju, izmantojot elektroforēzes metodi. Parasti šo metodi veic kopā ar želejas vārīšanu vai reducēšanu. Tomēr zimogrāfijā SDS-PAGE gēls tiek saglabāts neskarts. Pēc šī posma savienojuma SDS daļa tiek noņemta, izmantojot materiālu, kas pazīstams kā Triton X-100™, oksidācijas mazgāšanas līdzeklis no uzņēmuma BASF™. Šis materiāls tiek turēts 98 ° F (apmēram 37 ° C) ilgu laiku uzlabotā inkubatorā. Pēc tam bioķīmiķis notraipīs atlikušo materiālu, izmantojot melnu vai zilu savienojumu. Tas ļauj pētniekam noteikt, kur un kā notiek gremošana ar vielas fermentiem.
Lai gan SDS-PAGE gēls ir zimogrāfijā visbiežāk izmantotā viela, var izmantot cita veida materiālus, lai noteiktu fermenta sagremošanas ātrumu un spēju. Daudzas reizes tas ietver cietes plēves pievienošanu, lai palīdzētu vizuāli identificēt.
Bioķīmiķi un biomedicīnas inženieri parasti izmanto šo procesu, lai uzzinātu par jaunām enzīmu formām. Nosakot fermenta gremošanas ātrumu un kustības modeļus, var identificēt cilvēka un dzīvnieku olbaltumvielu atšķirīgās īpašības. To izmanto noteiktiem ģenētiskiem pētījumiem un analīzēm, kā arī zāļu un zāļu lietojumiem.
Zimogrāfijas process ir jārīkojas uzmanīgi. Lai gan to galvenokārt var izdarīt, ievērojot minimālus drošības pasākumus, jebkuram zinātniekam vai pētniekam, kas strādā ar materiāliem, noteikti jāizvairās no fiziska kontakta. Gan Triton X-100™ mazgāšanas līdzeklis, gan SDS-PAGE gēls var būt ļoti toksiski ādai.
Ir vairāki fermenti, kas nereaģē uz šo procesu, kā paredzēts. Piemēram, D. melanogaster gremošanas glikozidāzes var izdzīvot reducēšanās procesus cita veida gremošanas izmeklējumos. Turklāt tas izturēs karsēšanas procesu līdz pat 122°F (apmēram 50°C), kas krietni pārsniedz tradicionālajā zimogrāfiskajā procesā nepieciešamo līmeni. Kad ferments izdzīvo procesu, pilnībā nesagremot SDS-PAGE gēlu, pēdējos posmos tiek novērota palielināta joslas izšķirtspēja. Tas var radīt problēmas ar pareizu zimogrāfijas procesa rezultātu iegūšanu.