Aviācijas medicīnas eksperts veic fizisko pārbaudi potenciālajiem vai esošajiem gaisa satiksmes dispečeriem un pilotiem, lai palīdzētu noteikt, vai viņi ir piemēroti no tiem prasīto pienākumu veikšanai. Fiziskā pārbaude ietver detalizētas slimības vēstures iegūšanu un noteikšanu, vai pacientam ir veselības problēmas, kas var kavēt viņa vai viņas darba izpildi vai apdraudēt citus. Pēc tam aviācijas medicīnas eksperts šo informāciju kopā ar ieteikumu iesniedz medicīnas sertifikātu padomei. Persona var veikt šos pienākumus kā daļu no savas regulārās prakses vai strādāt aviokompānijā, lidostā vai pilotu apmācības programmā saistībā ar savu regulāro klīnisko praksi.
Medicīnas pārbaudītāja darba pirmā daļa ir pacienta pilnīgas slimības vēstures iegūšana. Tas ietver anamnēzes pieprasīšanu no pacienta primārās aprūpes ārsta un pacienta iztaujāšanu pārbaudes laikā. Nepieciešamā informācija parasti ietver ģenētisko veselības problēmu ģimenes anamnēzi, sirds problēmas un citas medicīniskas problēmas, kas, iespējams, ir nodotas pacientam. Aviācijas medicīnas ekspertam būs arī jāiegūst informācija no pacienta par viņa paša pagātnes veselības problēmām, viņa pašreizējo veselības stāvokli un informācija par pašreizējiem medikamentiem.
Pacienta fiziskā pārbaude ir arī daļa no aviācijas medicīnas eksperta. Šajā darba daļā ārsts pārbaudīs pacienta kustību diapazonu, klausīsies viņa sirdi un pārbaudīs refleksus. Tiek veikta arī detalizēta redzes pārbaude, kurā pārbauda pacienta redzi un perifēro redzi.
Kad visa vajadzīgā informācija ir savākta, aviācijas medicīnas eksperts sakārto informāciju saskaņā ar izdevējas aģentūras vadlīnijām un pacienta vārdā iesniedz to aģentūrai. Pamatojoties uz aviācijas medicīnas eksperta apmācību, ārsts parasti iekļauj informāciju par to, vai pacients atbilst visām viņa pieprasītās medicīniskās apliecības klases prasībām. Daudzos gadījumos pārbaudītājs pacientam izsniedz arī sava ziņojuma kopiju.
Lielākajā daļā valstu aviācijas medicīnas ekspertam ir jāuztur klīniskās medicīnas prakse, veicot pārbaudes pilotiem un gaisa satiksmes dispečeriem. Lielākā daļa aviācijas medicīnas ekspertu veic regulāru praksi vai strādā praksē un sniedz pakalpojumus vietējiem iedzīvotājiem, kuri vēlas iegūt medicīnisko izziņu. Dažos gadījumos aviācijas medicīnas eksperts noslēdz līgumu ar aviokompāniju vai pilotu apmācības skolu un nodrošinās medicīniskās pārbaudes tieši tiem, kas strādā aviokompānijā vai skolā, vai potenciālajiem pilotiem.