Trombocītu pārliešanai ir vairākas vieglas iespējamās blakusparādības, tomēr smagas reakcijas uz ārstēšanu ir reti sastopamas. Dažas no visbiežāk sastopamajām trombocītu pārliešanas blakusparādībām ir augsta temperatūra, nieze, izsitumi un drebuļi. Ja tiek ievadīti trombocīti ar aferēzi, var izvairīties no daudzām ārstēšanas blakusparādībām. Šāda veida trombocīti ir filtrēti no elementiem, kuriem, domājams, ir vislielākais kaitējuma potenciāls.
Lai samazinātu iespējamo blakusparādību ietekmi, pacienti tiek rūpīgi uzraudzīti, kamēr viņiem tiek veikta trombocītu pārliešana. Ja pacientam transfūzijas laikā rodas nevēlama reakcija, ārstēšana tiek pārtraukta. Zāles parasti tiek ievadītas arī reakcijas simptomu ārstēšanai.
Transfūziju efektivitāte var samazināties pēc vairākām procedūrām — stāvoklis, ko parasti sauc par pārliešanu izturīgu. Šim stāvoklim ir divi galvenie cēloņi: imūns un neimūns. Imunitātes izraisīta trombocītu efektivitātes samazināšanās varētu būt rezultāts tam, ka imūnsistēma noraida ienākošos trombocītus kā svešķermeņus un iznīcina tos, pirms tie sāk cirkulēt visā organismā. Ja tas notiek, ārsts var pārbaudīt pacienta asinis un meklēt tuvāku trombocītu atbilstību, cerot atrast transfūziju, ko organisms pieņems. Ar imūnsistēmu nesaistīti trombocītu uzņemšanas problēmu cēloņi ir reakcija uz pretsēnīšu zālēm, palielināta liesa, kas aiztur trombocītus un neļauj tiem iekļūt asinsritē, un neparasti augsta temperatūra.
Trombocītu pārliešana galvenokārt tiek veikta pacientiem ar zemu veselīgu trombocītu skaitu asins zuduma, asiņošanas, nepietiekamas trombocītu ražošanas trūkuma vai bojātu trombocītu dēļ. Daži no visbiežāk sastopamajiem stāvokļiem, kuru dēļ ārstēšanas laikā var būt nepieciešama pārliešana, ir autoimūna deficīta sindroms (AIDS), multiplā mieloma, aplastiskā anēmija un orgānu transplantācijas dalībnieki. Tos parasti ievada arī pacientiem, kuri ir iesaistīti kaulu smadzeņu transplantācijā vai ķīmijterapijā leikēmijas ārstēšanai.
Vairumā gadījumu ir nepieciešamas vairākas trombocītu pārliešanas, lai palielinātu to skaitu līdz atbilstošam līmenim. Tipisks ārstēšanas grafiks sastāv no divām transfūzijām nedēļā. Parasti ārsts varēs noteikt, vai pārliešana darbojas un kad tās var apturēt, mērot jaunos trombocītus ar RNS, ko sauc arī par tīklveida trombocītiem. Ja šāda veida trombocītu skaits palielinās, tad organisms atkal ražo savus trombocītus, nevis atkarīgs no pārliešanas.