Metronidazols ir antibiotika, ko visbiežāk lieto rosacejas, trichomoniāzes un bakteriālās vaginozes ārstēšanai. ASV Pārtikas un zāļu pārvalde (FDA) to klasificē B grūtniecības kategorijā, kas parasti nozīmē, ka pētījumos ar dzīvniekiem nav konstatēta kaitīga ietekme uz augli. Tomēr šīs zāles ir pierādījušas, ka tās palielina vēža risku, ja to lieto grūsnām žurkām, tāpēc grūtniecēm bieži tiek ieteikts izvairīties no metronidazola lietošanas grūtniecības laikā, ja iespējams. Pretrunīgie pierādījumi liecina, ka ārsti var izrakstīt metronidazolu grūtniecības laikā tikai tad, ja viņi uzskata, ka tas ir viens no medikamentiem, kas var atbrīvoties no noteiktām bakteriālām infekcijām, taču viņi mēdz vismaz pagaidīt, līdz ir pagājis pirmais trimestris.
Šīs zāles ir iekļautas B grūtniecības kategorijā, jo pētījumi ar dzīvniekiem nesniedz pierādījumus par kaitējumu mātei vai auglim. Tomēr viņi ir atklājuši, ka šīs zāles var izraisīt spontānu abortu, ja to injicē tieši grūsnu dzīvnieku vēderā. Turklāt šķiet, ka šīs zāles var darboties kā kancerogēns, jo žurkām un pelēm, kurām grūtniecības laikā tika ievadīts metronidazols, bija lielāka iespēja saslimt ar vēzi nekā tām, kuras šīs zāles nelietoja. Lai gan cilvēki un dzīvnieki bieži reaģē atšķirīgi uz medikamentiem, nav pabeigti pētījumi, lai pierādītu, vai šīs zāles palielina vēža risku cilvēkiem, tāpēc tās jālieto piesardzīgi.
Lai gan metronidazolu grūtniecības laikā var izrakstīt ārsti, kuri uzskata, ka tas ir vienīgais problēmas līdzeklis, parasti tas nav paredzēts pirmajā trimestrī. Ja to lieto vēlāk grūtniecības laikā, tas bieži tiek sadalīts mazās devās, jo vienas lielas devas lietošana var būt kaitīga. Arī mātes, kas baro bērnu ar krūti, tiek atturētas no zāļu lietošanas, jo daļa no tām nonāk mātes pienā, un 2011. gadā nav zināma ietekme uz bērnu.
Parasti ārsti parasti izraksta metronidazolu grūtniecības laikā tikai tad, ja ieguvumi pārsniedz risku. Piemēram, bakteriāla vaginoze var izraisīt priekšlaicīgas dzemdības un mazu dzimšanas svaru, ja tā netiek ārstēta, tāpēc ārsti var izrakstīt metronidazolu, lai atbrīvotos no infekcijas un ar to saistītajiem riskiem. Trichomoniāze var izraisīt arī mazu dzimšanas svaru, priekšlaicīgas dzemdības un priekšlaicīgu membrānu plīsumu, taču pierādījumi liecina, ka ārstēšana grūtniecības laikā ne vienmēr samazina šos riskus un pat var tos palielināt. Šī iemesla dēļ to var ārstēt tikai tad, ja simptomi ir ārkārtēji. Tāpat metronidazola lietošana grūtniecības laikā rosacejas ārstēšanai var nebūt piemērota, ja vien gadījums nav smags, jo šis stāvoklis reti rada ilgstošu kaitējumu mātei vai auglim, kas nozīmē, ka ārstēšana bieži vien var gaidīt, līdz bērns piedzimst.