Zinātnē paraugorganisms ir organisms, ko bieži izmanto pētījumiem un eksperimentiem, un to var uzskatīt par organismu klases reprezentatīvu piemēru vai arī tam ir īpaši interesanta vai viegli pētāma fizioloģija vai psiholoģija. Paraugorganismi tiek atlasīti arī ērtībai un ātrai pavairošanai. Piemēri: baktērija Escherichia coli, nematode Caenorhabditis elegans, augļu mušas (Drosophila melanogaster), albīna brūnās žurkas (Rattus norvegicus, sauktas arī par “laboratorijas žurkām”), peles (Mus musculus) un cilvēki (Homo sapiens). Šis ir tikai īss saraksts — kopumā ir vairāki desmiti modeļu organismu, sākot no vīrusiem līdz sēnēm un beidzot ar augiem un gan bezmugurkaulniekiem, gan mugurkaulniekiem.
Paraugorganismi ir iemācījuši zinātniekiem un līdz ar to arī cilvēcei milzīgu informāciju par bioloģiju un psiholoģiju. Paraugorganismu dēļ mēs zinām, ka smadzenes sastāv no neironiem, ķermeņi darbojas tīri mehāniski (nevis tos rosina “dzīvības spēks”, kā apgalvoja Anrī Bergsons 1907. gadā), kā katrs orgāns darbojas ļoti detalizēti, un kā slimības un mutācijas ietekmē ķermeni.
Dzīvnieku tiesību aktīvistu sarūgtinājumam, vardarbīgos eksperimentos dažkārt tiek nopietni ļaunprātīgi izmantoti vai spīdzināti paraugorganismi. Daudzas iestādes ir reaģējušas, eksperimentējot ar zemāka modeļa organismiem vai, ja iespējams, izmantojot datorsimulācijas, veicot humānākus eksperimentus un atturoties no eksperimentiem ar augstāka modeļa organismiem, ja vien tas nav absolūti nepieciešams.
Paraugorganisma sarežģītība parasti liecina par to, ko tas tiek izmantots pētīšanai. Piemēram, nematodes ir diezgan vienkārši daudzšūnu organismi, un tos bieži izmanto, lai pētītu fizioloģijas pamatus, piemēram, veidu, kā smadzenes virza ķermeņa daļas. Lielisks piemērs tam ir nematode C. elegans, kas ir tik plaši pētīta, zinātnieki zina, kur katra tās ķermeņa šūna nonāk un kā šīs šūnas attīstās un diferencējas embrioģenēzes procesā. Sarežģītākos pētījumos, piemēram, redzes vai smalko psiholoģisko pazīmju pētījumos, izmanto sarežģītākus dzīvniekus, piemēram, kaķus vai žurkas.