Dažādus apdraudētos bruņurupuču veidus var iedalīt divās galvenajās grupās. Jūras vai jūras bruņurupuči saskaras ar nopietniem draudiem mūsu okeānos un uz sauszemes ligzdošanas vietu iznīcināšanas un komerciālās zvejas dēļ. Arī saldūdens bruņurupučiem, īpaši Āzijā, draud izmiršana biotopu zaudēšanas un nelegālās tirdzniecības dēļ. Vairākas aģentūras un organizācijas visā pasaulē strādā, lai uzlabotu šo sugu izdzīvošanas iespējas.
Sešas no septiņām jūras bruņurupuču sugām ir uzskaitītas kā apdraudētas vai apdraudētas saskaņā ar Apdraudēto sugu likumu (ESA). Šīs sugas ir meža bruņurupuči, zaļie bruņurupuči, Kemp’s ridley bruņurupuči, ādas bruņurupuči, hawksbill bruņurupuči un olīvu bruņurupuči. Lai gan šie apdraudētie bruņurupuči dzīvo okeānā, tie pārojas un dēj olas uz sauszemes. Vietas, kuras viņi bieži izmanto šim nolūkam, ir tikušas iznīcinātas, tādējādi bruņurupučiem ir grūtāk atrast piemērotas alternatīvas, kur to olas var droši izšķilties. Citi jūras bruņurupuču populācijas samazināšanās iemesli ir laivu notriekšana, komerciālās zvejas nozveja un atlūzu ieslodzīšana.
Tā kā šīs jūras bruņurupuču sugas apdzīvo ASV ūdeņus, Nacionālais jūras zvejniecības dienests (NMFS) un ASV Zivju un savvaļas dzīvnieku dienests (FWS) aktīvi iesaistās šo sugu saglabāšanā. NMFS veic saglabāšanas pasākumus, kuru mērķis ir samazināt to bruņurupuču skaitu, kurus skāruši ūdens transportlīdzekļi un nozvejotas zvejniecībā. FWS nodrošina aizsardzību un atjaunošanas pasākumus šo apdraudēto bruņurupuču ligzdošanas vietām. EKA nodrošina šīm sugām papildu tiesisko aizsardzību.
Saldūdens bruņurupuču sugas visā pasaulē ir skārušas biotopu iznīcināšana un citi populācijas samazināšanās cēloņi. Šī problēma rada lielas bažas par saldūdens bruņurupuču pastāvēšanu Āzijā. Visas šajā reģionā sastopamās sugas tiek uzskatītas par apdraudētām vai apdraudētām. To skaitā ir tādas sugas kā melnais dīķa bruņurupucis, četru acu bruņurupucis, Malaizijas milzu bruņurupucis, bruņurupucis ar dzeltenām malām un bruņurupucis ar kauliņiem.
Galvenie draudi šiem apdraudētajiem bruņurupučiem ir nelegāla savvaļas dzīvnieku tirdzniecība, biotopu degradācija un medības. Saldūdens bruņurupučus bieži sagūst un pārdod gaļas, medikamentu un mājdzīvnieku tirdzniecības tirgos, lai gan ir likumi, kas aizliedz šīs darbības. Mednieki Āzijas dienvidu daļā tos arī ķer, lai pabarotu savus vietējos iedzīvotājus. Daudzas saldūdens bruņurupuču apdzīvotās vietas ir izpostītas ugunsgrēkos vai pārvērstas par lauksaimniecības zemi.
Tādas organizācijas kā Pasaules Dabas fonds, Starptautiskā Dabas aizsardzības savienība un Bruņurupuču izdzīvošanas alianse pieliek pūles, lai nodrošinātu stingrāku likumu izpildi, kas aizsargā saldūdens bruņurupučus no nelegālās tirdzniecības. Citi saglabāšanas pasākumi ietver drošu biotopu atrašanu vai izveidi. Šīs organizācijas arī palīdz vairāk cilvēku apzināties šo sugu apdraudējumu.