Amigdala, kas atrodas smadzeņu limbiskajā sistēmā, ir smadzeņu struktūra, kas iesaistīta emocionālo stimulu apstrādē, kā arī to piesaistē atmiņā. Amigdala bojājumiem var būt vairākas atšķirīgas sekas, tostarp nespēja radīt vai izpildīt bailes reakcijas uz konkrētiem stimuliem. Ietekme var ietvert arī pazeminātas mātes uzvedības izpausmes. Riskanti uzvedība, piemēram, azartspēles ar zemām izredzēm, var palielināties arī pēc šīs smadzeņu zonas bojājumiem.
Parasti amigdala palīdz smadzenēm kodēt un izteikt bailes. Pēc apdraudošu stimulu iedarbības smadzenes šos apstākļus iegaumē, un stimula atkārtota parādīšanās izraisīs baiļu reakciju. Daži bojājumi pilnībā dzēsīs šo reakciju. Persona ar šo bojājumu nesaistīs baiļu reakcijas ar stimuliem. Arī iepriekš iegūtās baiļu reakcijas netiks izteiktas stimulu klātbūtnē.
Šajā jomā tiek izplatītas citas emocijas, izņemot bailes. Pētījumos ar pērtiķiem amigdalas bojājumi lika mātēm pārstāt izrādīt mātes uzvedību. Dažos gadījumos mātes uzbruka saviem mazuļiem vai tos ļaunprātīgi izmantoja. Visas amigdalas bojājumi abās smadzeņu pusēs izraisīja Kluver-Bucy sindromu pērtiķiem. Šis traucējums izraisa agresijas un baiļu trūkumu, kā arī nepiemērotu seksuālo uzvedību.
Palīdzēt cilvēkiem atpazīt emocijas ir vēl viena funkcija, ko var ietekmēt bojājumi. Cilvēki, kuriem bija amygdala bojājumi abās smadzeņu pusēs, nespēja atpazīt emocijas, kas saistītas ar sejas izteiksmēm. Reizēm viņi pat sajauca dusmīgus izteicienus ar smaidiem. Kad šīm personām tika parādītas emocionālas izteiksmes bez sejām, viņi varēja atpazīt parādītās emocijas. Šis rezultāts parāda, ka smadzenēs ir citi centri, kas palīdz cilvēkiem atpazīt emocijas.
Izvairīšanās no zaudējumiem ir termins, kas apraksta izvairīšanos no riska, it īpaši, ja šie riski neradītu ievērojamu peļņu. Amygdala bojājumi cilvēkiem radīja nespēju praktizēt nepatiku pret zaudējumiem. Šie cilvēki azartspēlēs sliecās uzņemties lielus riskus pat tad, ja no laimestiem viņi nevarēja nopelnīt daudz naudas. Riska uzņemšanās, kas neradīja iespēju indivīdam kaut ko zaudēt, netika ietekmēta.
Citu cilvēku noteikšana personīgajā telpā ir vēl viena amigdalas funkcija, kas var tikt ietekmēta. Kad amygdala ir bojāta abās smadzeņu pusēs, cilvēki nereaģē uz citiem, kas stāv savā personīgajā telpā. Šis efekts var būt saistīts ar to, ka indivīdi neatšķir stāvēšanu blakus kādam no viņiem un kādu attālumu no tiem.