Krampji rodas, ja kāda smadzeņu daļa kļūst pārāk uzbudināta vai kad smadzeņu nervi sāk neparasti sašaut kopā. Krampju aktivitāte var rasties smadzeņu apgabalos, kas ir nepareizi veidoti iedzimtu defektu vai ģenētisku traucējumu dēļ vai ko izraisa infekcija, ievainojumi, audzēji, insulti vai nepietiekama skābekļa padeve. Krampju patofizioloģija rodas no pēkšņas nelīdzsvarotības starp spēkiem, kas ierosina un kavē nervu šūnas, tādējādi ierosinošie spēki ir pārāki. Šis elektriskais signāls pēc tam izplatās uz apkārtējām normālajām smadzeņu šūnām, kuras sāk darboties kopā ar patoloģiskajām šūnām. Ar ilgstošām vai atkārtotām krampjiem īsā laika periodā palielinās turpmāku krampju risks, jo notiek nervu šūnu nāve, rētaudi veidošanās un jaunu aksonu dīgšana.
Nervu šūnām starp izlādiem parasti ir negatīvs iekšējais lādiņš, jo no šūnas tiek aktīvi izsūknēti pozitīvi lādēti nātrija joni. Nervu šūnas izlāde vai aizdegšanās ietver pēkšņu negatīvā lādiņa svārstības uz pozitīvu lādiņu, jo jonu kanāli šūnā atveras un pozitīvie joni, piemēram, nātrijs, kālijs un kalcijs, ieplūst šūnā. Gan ierosinošie, gan inhibējošie kontroles mehānismi darbojas, lai nodrošinātu atbilstošu izšaušanu un novērstu nepiemērotu šūnas ierosmi. Krampju patofizioloģija var rasties pastiprinātas nervu šūnas uzbudinājuma, samazinātas nervu šūnas inhibīcijas vai abu ietekmju kombinācijas dēļ.
Parasti pēc nervu šūnas aizdegšanās inhibējošā ietekme novērš neirona otro aizdegšanos, līdz neirona iekšējais lādiņš atgriežas miera stāvoklī. Gamma-aminosviestskābe (GABA) ir galvenā smadzeņu inhibējošā ķīmiskā viela. GABA atver kanālus negatīvi lādētiem hlorīda joniem, kas ieplūst satrauktajā neironā, kas samazina iekšējo lādiņu un novērš nervu šūnas otru aizdegšanos. Lielākā daļa pretkrampju zāļu samazina krampju patofizioloģiju, palielinot hlorīda kanālu atvērumu biežumu vai palielinot kanālu atvērtības ilgumu. Ja rodas traucējumi šūnās, kas izdala GABA, vai GABA receptoru vietās, hlorīda kanāli nespēj atvērt un mazināt nervu šūnas uzbudināmību.
Vienlīdz nozīmīgi krampju patofizioloģijai ir mehānismi, kas izraisa pastiprinātu neironu ierosmi. Glutamāts ir galvenais ierosinošais ķīmiskais mediators smadzenēs, kas saistās ar receptoriem, kas atver nātrija, kālija un kalcija kanālus šūnā. Dažas iedzimtas krampju formas ir saistītas ar noslieci uz pārmērīgi biežu vai ilgstošu glutamāta receptoru aktivāciju, palielinot smadzeņu uzbudināmību un krampju aktivitātes izredzes. Turklāt elektriskās aktivitātes nepārtraukta izplatīšanās gar slāņveida smadzeņu daļām var notikt no šūnas uz šūnu, kas ir neķīmiska izplatīšanās forma, kas nav pakļauta inhibējošu mehānismu regulējumam.
Krampju patofizioloģijas ārstēšana ir vērsta ne tikai uz molekulārām novirzēm, kas saistītas ar jonu kanāliem nervu šūnās, bet arī uz neķīmisku ierosmes izplatīšanos smadzenēs. Benzodiazepīni, piemēram, valijs, un barbiturāti, piemēram, fenobarbitāls, atver inhibējošus hlorīda kanālus. Fenitoīns vai Dilantin novērš atkārtotu neironu izšaušanos, slēdzot nātrija kanālus nervu šūnās. Situācijās ar slikti pārvaldītām atkārtotām krampjiem halotāns var novērst nervu impulsu neķīmisku pārnešanu. Turklāt insulīns un steroīdi maina glutamāta receptoru darbību, nomācot smadzeņu uzbudināmību.