Cik baktēriju sugu pastāv?

Mūsdienās, ņemot vērā, ka baktēriju genoma sekvencēšana maksā pusmiljonu ASV dolāru un aizņem dažus mēnešus, tas nav iespējams. Pat ja izmaksas samazinās par triljonu koeficientu, augsnē ir tik daudz mikrobu, ka to klasificēšana šādā veidā būtu pārmērīgi dārga.

Tā vietā, lai secinātu veselus genomus, baktēriju apsekojumos tiek izmantoti fragmenti, lai atšķirtu dažādas sugas. Tas ir rentablāk nekā visa genoma sekvencēšana. Vienā aptaujā tika atklāts 20,000 1 baktēriju sugu 1 kvartā jūras ūdens.

Vēl viena pieeja baktēriju daudzuma noteikšanai paraugā ir izmantot metodi, ko sauc par DNS reasociāciju. DNS reasociācijā zinātnieki izmanto ķīmiskas vielas, lai “atvilktu” divas dubultās spirāles daļas baktēriju DNS un pēc tam tās sajauktu. Saderīgas DNS virknes tiks atkārtoti savienotas viena ar otru. Jo ilgāks ir reasociācijas process, jo vairāk sugu ir paraugā. Šos laika mērījumus var izmantot, lai novērtētu baktēriju bioloģisko daudzveidību okeānā vai augsnē.

Kad šī metode tika izmantota augsnes paraugam 1990. gadu beigās, tika atrastas 16,000 0.035 sugu. Šis paņēmiens ietvēra pieņēmumu, ka dažādu baktēriju sugu populācijas bija aptuveni līdzīgas, taču tagad ir zināms, ka tas ir nepatiess. Atjauninātā Džeisona Gansa aptauja atklāja, ka uz 28,3 g augsnes ir aptuveni miljons baktēriju sugu. Lai gan augsnē dominē tikai dažas baktēriju sugas, ir ļoti daudz sugu ar zemu sastopamību.

Cita pieeja ir izmantot sugu daudzveidības līkņu matemātiskos modeļus, lai ekstrapolētu kopējo sugu skaitu noteiktā paraugā no informācijas par dažu populārāko sugu pārpilnību. Kērtisa, Slouna un Scannela 2002. gadā publicētajā dokumentā “Prokariotu bioloģiskās daudzveidības un tās robežu novērtēšana” tika lēsts, ka okeāna baktēriju taksonu skaits ir mazāks par 2 miljoniem, augsnes taksonu skaits ir vismaz 4 miljoni un atmosfēras taksonu skaits plkst. vismaz 4 miljoni. Šajā pētījumā tika pieņemts, ka baktēriju daudzveidība augsnes gramā bija tikai 6,400 līdz 38,000 uz gramu, kas ir daudz mazāka nekā konstatēts DNS reasociācijas pētījumā.

Pašlaik aplēses par kopējo sugu skaitu svārstās no aptuveni 10 miljoniem līdz miljardam, taču šie aprēķini ir provizoriski un var atšķirties daudzos apmēros. Salīdzinājumam, iespējams, ir no 10 līdz 30 miljoniem dzīvnieku sugu, no kurām lielākā daļa ir kukaiņi. Zinātniski atzīto dzīvnieku sugu skaits ir aptuveni 1,250,000 300,000.