Laparoskopiskā ķirurģija ir visizplatītākā procedūra, ko veic, lai diagnosticētu endometriozi un izņemtu endometrija cistas — nevēža masas, kas satur endometrija audu daļiņas. Atkarībā no pacienta un viņas endometriozes smaguma pakāpes, laparoskopiskā operācija var būt ārkārtīgi efektīva ārstēšana. Operācija ir minimāli invazīva un parasti tiek veikta ambulatorā veidā. Pacienti bieži izjūt tūlītēju sāpju mazināšanos, un daudzos gadījumos ir iespējama auglības palielināšanās. Operācijas rezultāti var būt pastāvīgi, taču daudzām sievietēm ir recidīvi un nepieciešama turpmāka ārstēšana.
Endometriozes laparoskopiskās operācijas laikā jūras kaula pamatnē tiek veikts neliels iegriezums. Vēders ir piepildīts ar gāzi — parasti oglekļa dioksīdu —, kas piepūš vēderu, ļaujot ārstam vieglāk redzēt, kad viņš ir ievietojis laparoskopu — mazu, apgaismotu instrumentu ar kameru, kas ļauj ķirurgam pārbaudīt pacienta dzemdi un olnīcas bez veic atklātu operāciju. Bieži vien endometriozes diagnosticēšanai tiek veikta laparoskopiskā operācija. Ja tiek konstatēta endometrioma, to var noņemt. Lai to izdarītu, ķirurgs veic vienu vai vairākus papildu iegriezumus vēderā, caur kuriem viņš var ievietot savus ķirurģiskos instrumentus.
Ginekologs var ieteikt laparoskopisku endometriozes operāciju, ja viņa pacientam rodas patoloģiskas sāpes, kas saistītas ar menstruālo ciklu, neauglību vai citiem endometriozes simptomiem. Endometriozes laparoskopiskās operācijas priekšrocība ir tā, ka tā ir salīdzinoši īsa procedūra, kas parasti ilgst no 30 līdz 45 minūtēm. To var veikt ambulatorā veidā, un atveseļošanās laiks pēc operācijas parasti ir tikai dažas dienas līdz nedēļa. Sievietēm, kurām ir sāpes vēderā, laparoskopiskā ķirurģija daudzos gadījumos var nodrošināt tūlītēju sāpju mazināšanu, savukārt alternatīva ārstēšana, piemēram, hormonu terapija, var nebūt.
Sievietēm, kuras vēlas atbrīvoties no sāpēm, kas saistītas ar endometriozi, laparoskopiskā operācija pirmajos mēnešos pēc operācijas ir efektīva 70 līdz 100% sieviešu. 45% sieviešu simptomi atkārtojas pirmajā gadā pēc operācijas. Jo progresīvāka ir endometrioze, jo lielāka iespēja, ka sievietei atkārtosies endometrioze vai endometrija sāpes. Endometriozes laparoskopiskās operācijas laikā ķirurgs var iztukšot vai izgriezt endometriomas daļu, vai arī viņš var pilnībā noņemt endometrija cistu. Daudzi ārsti iesaka veikt pilnīgu izņemšanu kā visefektīvāko metodi endometrija sāpju mazināšanai un endometriozes atgriešanās novēršanai.
Sievietēm, kuru neauglība ir saistīta ar endometriozi, pēc endometriozes laparoskopiskās operācijas ir dažādi rezultāti. Laparoskopija šķiet mazāk efektīva vieglos endometriozes gadījumos. Tomēr vidēji smagos un smagos gadījumos endometriozes laparoskopiskā operācija var būt noderīga un var izraisīt auglības palielināšanos. Citi faktori, kas lielā mērā nosaka sievietes auglību pēc endometriozes laparoskopiskās operācijas, ir viņas vecums, olšūnu dzīvotspēja un spontāna aborta risks.