Galvenā atšķirība starp antivielu un proteīnu ir tāda, ka, lai gan visas antivielas ir olbaltumvielas, ne visas olbaltumvielas ir antivielas. Olbaltumvielas ir vispārīga lielu molekulu kategorija, kas kalpo gan kā strukturālas, gan funkcionālas vienības visiem dzīvajiem organismiem uz Zemes. Tie ir arī 20 neaizvietojamo aminoskābju molekulu krātuve augos un dzīvniekos, kas ir nepieciešamas cilvēka izdzīvošanai, bet kuras cilvēka ķermenis nevar ražot pats no citiem ķīmiskajiem prekursoriem. Antivielas ir īpašs Y formas proteīna veids, kas darbojas kā daļa no imūnsistēmas un satur īpašas saistīšanās vietas antigēnu vietām uz vīrusiem un baktērijām, no kurām šādi organismi vairojas paši. Ja antivielas ir ievērojamā daudzumā, tās kavē vīrusu un baktēriju vairošanos organismā, saistoties ar antigēniem, un izraisa citas imūnās atbildes, lai nodrošinātu arī veselību.
Vēl viena galvenā gan antivielu, gan proteīna iezīme, kas ir svarīga to funkcijā, ir molekulu salocīšana vai forma, jo tas ietekmē to spēju saistīties ar citām molekulām un labvēlīgi mijiedarboties šūnu vidē. Lai gan antivielai un olbaltumvielai var būt atšķirīga ķīmiskā struktūra, dažos gadījumos to krokas arhitektūra var būt līdzīga, kas tieši ietekmē lomu, kādu tie jebkurā brīdī spēlē organismā. Pašreizējās datubāzēs no 2011. gada ir identificēts tikai ierobežots skaits faktisko locījumu modeļu, kas sastopami dabā, lai gan teorētiski varētu būt miljoniem dažādu kombināciju. Aplēses liecina, ka antivielu un olbaltumvielu modeļi ir no 1,233 līdz 1,393 reizēm. Visām antivielām ir unikāla Y forma, taču Y augšējā daļā ir specifiskas aminoskābju receptoru vietas, kur abas šī reģiona zari var vienlaikus saistīties ar diviem atsevišķiem antigēniem, lai tās atspējotu.
Galvenā atšķirība starp antivielu un proteīnu ir arī reģions, no kura tās tiek ražotas. Lai gan proteīnu sintēze ir dabisks rezultāts, apvienojot aminoskābju sekvences dažāda veida šūnās no dezoksiribonukleīnskābes (DNS), antivielām ir ierobežotākas ražošanas metodes. Antivielas bieži sauc par imūnglobulīniem to saistīšanās lomai imūnsistēmā, un šīs molekulas parasti ražo tikai B-limfocītu vai B-šūnu struktūras, kas pazīstamas arī kā baltās asins šūnas vai plazmas šūnas, kas atrodas kaulu smadzenēs.
Atšķiras arī vispārējā antivielu un olbaltumvielu klasifikācija. Lai gan pastāv vismaz 100 dažādu veidu olbaltumvielu molekulas un tās pilda daudzas molekulāras funkcijas, sākot no motoriskās aktivitātes atvieglošanas līdz DNS katalīzei, antivielas ir vai nu monoklonālas, vai poliklonālas. Monoklonālās antivielas spēj saistīties tikai ar vienu specifisku antigēnu un tiek dabiski ražotas organismā, reaģējot uz svešiem iebrucējiem. Savukārt poliklonālās antivielas tiek iegūtas no imunizētu dzīvnieku asinīm, un tās var konstruēt tā, lai tās pievienotos plašam antigēnu klāstam.
Organismi dabiski stimulē antivielu veidošanos, lai pasargātu sevi no infekcijām, taču arī medicīnas zinātne ir ļoti iesaistīta pētniecisko antivielu izveidē, un tagad pastāv lieli antivielu katalogu saraksti, kuros laboratorijas var pasūtīt antivielas, kas tām ir vajadzīgas konkrētām pētniecības interesēm. Poliklonālo antivielu piegādātāju skaits visā pasaulē 180. gadā bija vismaz 2011 uzņēmumi, no kuriem daudziem ir pārdošanai un nosūtīšanai pieejami vairāk nekā 20,000 XNUMX dažādu antivielu saraksti, tostarp arī dažas monoklonālās antivielas.