Kas ir peptīdu antigēns?

Peptīdi ir organiskas molekulas, kas sastāv no slāpekļa, skābekļa, oglekļa, ūdeņraža un parasti sēra. Tās ir aminoskābju ķēdes un ir saistītas ar peptīdu saiti. Peptīdu saites ir divu blakus esošo aminoskābju NH2 un COOH grupu saites.

Antigēns ir molekula, kas saistās ar antivielu un rada imūnreakciju, ķermeņa reakciju uz molekulām, kas šķiet svešas. Ne visu veidu molekulas spēj atpazīt imūnsistēma. Olbaltumvielas, peptīdi un cukuru ķēdes var darboties kā antigēni.

Ir arī cilvēka antigēni. Tie ietver proteīnus, kas atrodas uz audzēja šūnu virsmas. Šādi antigēni var būt arī asinīs. Tas ir pamats prostatas specifisko antigēnu testēšanai, ko parasti izmanto prostatas vēža skrīningam. Daži antigēni tiek apzināti ieviesti, lai darbotos kā vakcīnas un radītu imūnreakciju.

Antivielas ir olbaltumvielas asinīs, kas neitralizē noteiktu antigēnu. Antivielas atpazīst tikai dažas molekulas daļas. Antivielas gals satur paratopu, kas atpazīst antigēna sarežģīto struktūru. Šis antivielu reģions ir atbildīgs par lielo organismā esošo antivielu daudzveidību. Vienam indivīdam var būt miljoniem dažādu antivielu.

Bieži vien tiek izmantoti peptīdu antigēni, jo tie ir daļa no lielāka proteīna, kas, iespējams, nav attīrīts. Izmantojot peptīda antigēnu, lai izveidotu antivielas, ir svarīgi, lai pētnieks izmantotu peptīda antigēnu sadaļu. Antigēnu speciālisti var palīdzēt izstrādāt antigēnu, lai palielinātu iespēju, ka peptīds, ko izmanto kā antigēnu, radīs antivielu. Ir daudz vieglāk paredzēt, kuri epitopi ir pakļauti, ja ir zināšanas par savienojuma trīsdimensiju struktūru.

Vairumā gadījumu nav zināšanu par peptīda vispārējo struktūru, lai gan prognozēšanas programmatūra var analizēt, kura peptīda sadaļa varētu būt antigēna. Peptīdi, kas, visticamāk, saskarsies ar antivielām, ir tie, kas atrodas uz šūnas virsmas. Tie, visticamāk, ir hidrofīli – šķīst ūdenī. Elastība ir arī svarīgs kritērijs, lai peptīdu antigēns reaģētu ar epitopu.

Kad ir identificēts piemērots peptīda antigēns, tiek izveidots sintētisks peptīds. Pēc tam to var izmantot imunizācijā. To injicē dzīvniekam, lai radītu imūnreakciju. Kad antivielas ir izolētas, tās tiek analizētas, lai pārliecinātos, ka organisms ir izveidojis efektīvu imūnreakciju.

Viens izplatīts veids, kā pārbaudīt, vai antivielas ir specifiskas vēlamajam proteīnam, ir veikt Western Blot. Tas ietver proteīnu, kas satur peptīdu, atdalīšanu uz želejas, izmantojot elektrisko strāvu. To sauc par elektroforēzi. Pēc tam olbaltumvielas tiek pārnestas uz membrānu un pārbaudītas ar antivielu.

Ja proteīnam ir specifiska antiviela, tā saistās ar proteīnu uz membrānas. Membrānu mazgā un pēc tam apstrādā ar sekundāru antivielu. Ja, piemēram, antivielas tika izstrādātas pelē, sekundārā antiviela būtu anti-peles antiviela. Šī antiviela ir izstrādāta, lai radītu krāsu vai luminiscenci, lai pētnieks varētu redzēt, kur sākotnējā antiviela ir saistījusies.