Līdz 20. gadsimta vidum zinātnieki un veselības speciālisti emocionālās reakcijas un kognitīvo kondicionēšanu lielākoties uzskatīja par divām atsevišķām vienībām. Tomēr, attīstoties pētījumam par izziņu un emocijām, daudzas autoritātes mainīja savus uzskatus par absolūtas atšķirības starp abiem stāvokļiem. Lai gan joprojām nav vienprātības, zinātniskie viedokļi ir sākuši radīt priekšstatu, ka starp izziņu un emocijām ir iespējama saikne.
“Izziņa” parasti attiecas uz mācīšanās un spriešanas psiholoģisko apstrādi. Tas ietver dabisku līdzdalību abstraktās darbībās, kas saistītas ar atmiņu, plānošanu, problēmu risināšanu un uztveri. Kognitīvās funkcijas var rasties, tās īpaši neapzinoties vai tieši reaģējot uz ārēju ievadi. Piemēram, vienkārša kognitīva reakcija uz ārkārtējām briesmām ir izkļūšanas iespēja, kas var notikt gandrīz automātiski vai pēc vismaz dažām minūtēm problēmu risināšanai. Vēl viens vienkāršs piemērs ietver kognitīvu izvēli, lai izslēgtu ārējos traucējumus, līdz konkrēts uzdevums ir pabeigts.
No otras puses, emocijas vēsturiski pārkāpj viegli pieņemamu definīciju. Starp dažādiem emociju stāvokļu skaidrojumiem garīgās veselības iestādes parasti piekrīt teorijai, ka emocijas rodas atalgojuma vai soda nosacījumu dēļ. Ārsti, kas nāk no vairāk klīniskas vai medicīniskās vides, varētu dot priekšroku teorijai, ka cilvēka ķermenis informē par emocionālām reakcijām. Šī pēdējā grupa lielākoties uzskata, ka emocijas ir saistītas ar smadzeņu struktūrām, piemēram, amigdalu, hipokampu un hipotalāmu. Neatkarīgi no tā, kādai teorijai viņi galu galā izvēlas ticēt, lielākā daļa speciālistu, kas pēta smadzeņu darbību, ir vienojušies, ka emocijas, šķiet, ietekmē kognitīvos procesus, un izziņa ietekmē emocionālās reakcijas.
Izziņa un emocijas ir saistītas daudzos veidos. Anatomiski divvirzienu savienojumi, kas ietver prefrontālās un priekšējās smadzeņu struktūras, saista emociju pieaugumu ar saistīto autonomo kognitīvo uzdevumu veiksmīgu izpildi. Turklāt stimuls, kas izraisa indivīda emocionālu reakciju, vienlaikus stimulē kognitīvās reakcijas. Piemēram, emocionāls vizuālais saturs var aktivizēt smadzeņu garozu, izraisot pastiprinātus kognitīvos procesus, kas saistīti ar veidu, kā vizuālā sistēma uztver un apstrādā informāciju.
Vēl viena saikne starp izziņu un emocijām ir saistīta ar veidu, kā ķermenis mācās reaģēt noteiktās situācijās. Šī teorija, ko daudzi zinātnieki sauc par kognitīvo emociju regulēšanu, apraksta, kā cilvēks var pārvērtēt stimulu kopumu pēc intensīvas emocionālas reakcijas. Šāda veida kognitīvā pārvērtēšana var rasties smadzeņu struktūras mijiedarbības dēļ, kas ietver amigdalu, kas parasti tiek stimulēta, kad cilvēks reaģē uz emocionālo ievadi, un salu garozu.