Galvenā saikne starp ķermeņa smaku un slimībām ir simptomātisku blakusparādību jomā. Ķermeņa smaka var būt noteiktas slimības sekundārs simptoms, tāpēc parasti šāda veida problēmas ir iespējams kontrolēt ārsta uzraudzībā. Labākais veids, kā cilvēks var noteikt, vai pastāvīga ķermeņa smaka rodas slimības, nevis baktēriju klātbūtnes vai hormonālo izmaiņu dēļ, ir uzzināt vairāk par slimību, pievērst uzmanību ķermeņa smaržas izmaiņām un ziņot par šādām izmaiņām ārstam.
Vispazīstamākā korelācija starp ķermeņa smaku un slimībām rodas pacientiem, kuri cieš no hiperhidrozes, ko sauc arī par pārmērīgu svīšanu. Lai gan hiperhidroze lielākoties ir nopietns stāvoklis, tās biežākās blakusparādības ir mitrums un pastiprināta ķermeņa smaka. Labākais veids, kā novērst smaku cilvēkiem, kuri cieš no šīs slimības, ir bieža vannošanās kopā ar pretsviedru līdzekļu, dezodorantu un dažkārt arī antiholīnerģisko medikamentu lietošanu.
Cilvēki, kuri cieš no cukura diabēta, var periodiski pamanīt mainīgus ķermeņa smakas simptomus. Vairumā gadījumu nepatīkamas ķermeņa smakas cēlonis diabēta slimniekiem ir nepareiza cukura līmeņa kontrole asinīs, kas var izraisīt ketoacidozi vai paaugstinātu ketonvielu daudzumu asinīs vai ķermeņa audos. Lai novērstu šāda veida saikni starp ķermeņa smaku un slimībām, diabēta pacientiem stingri jāievēro noteiktie ārstēšanas plāni, kas ir paredzēti, lai kontrolētu un uzturētu cukura līmeni asinīs.
Viena reta saikne starp ķermeņa smaku un slimību ir trimetilaminūrija, ģenētiska slimība, kuras gadījumā organisms nespēj pārstrādāt savienojumu, ko sauc par trimetilamīnu. Kad šis savienojums uzkrājas ķermeņa audos, skartā persona bieži izdala nepatīkamu ķermeņa smaku, kas ļoti smaržo pēc puves zivīm. Visbiežāk trimetilaminūrija rodas no autosomāli recesīvām FMO3 gēnu mutācijām, bet dažkārt vaininieks ir nieru slimība, uztura proteīni, piemēram, no olām, pākšaugiem vai zivīm, vai trimetilamīnu izraisošo baktēriju palielināšanās gremošanas sistēmā.
Vēl viena slimība, kas izraisa nepatīkamu ķermeņa smaku, ir fenilketonūrija (PKU), reta vielmaiņas slimība, kas var bojāt nervu sistēmu un izraisīt garīgu atpalicību. Daudzi vecāki ir zināmā mērā pazīstami ar šo slimību, jo pirmais tests, ko jaundzimušais saņems, bieži ir PKU tests, ko parasti veic neilgi pēc dzimšanas, izmantojot asins paraugu, kas iegūts no bērna papēža. Neatkarīgi no nopietnākiem simptomiem, cilvēki, kuriem ir PKU, bieži izdala slapju ķermeņa smaku, jo ir pārāk daudz aminoskābes fenilalanīna.
Citi ķermeņa smakas un slimību gadījumi var rasties simptomātiski cilvēkiem, kuri cieš no aknu slimībām, alkoholisma vai sēnīšu infekcijām. Uztura nelīdzsvarotība un minerālvielu trūkums var izraisīt arī ķermeņa smaku. Konsultācijas ar ārstu vai citu veselības aprūpes speciālistu var palīdzēt atklāt ķermeņa smakas izmaiņu iemeslus.