Antibiotikām un caurejai ir vairākas saistības. Piemēram, caureja ir daudzu antibiotiku bieža blakusparādība. Ārstēšana ar antibiotikām var izraisīt arī ar antibiotikām saistītu caureju, kas ir slimība, ko izraisa parasto kuņģa-zarnu trakta baktēriju nāve. Turklāt dažādus infekciozus caurejas cēloņus var ārstēt ar antibiotikām.
Daudzas antibiotikas izraisa caureju kā blakusparādību. Makrolīdu grupas antibiotikas, kas ietver zāles klaritromicīnu, azitromicīnu un eritromicīnu, parasti izraisa caureju. Tetraciklīna zāles, tostarp tetraciklīns, demeklociklīns un minociklīns, var izraisīt arī caureju. Kuņģa-zarnu trakta problēmas, sākot no sliktas dūšas līdz caurejai, bieži tiek novērotas ar cefalosporīnu antibiotikām, tostarp cefaleksīnu, cefepīmu un ceftriaksonu.
Ar antibiotikām saistīta caureja ir vēl viena saikne starp antibiotikām un caureju. Tas ir stāvoklis, kas attīstās pēc antibiotiku terapijas uzsākšanas infekcijas ārstēšanai. Vienlaikus ar infekciju izraisošo baktēriju nogalināšanu, antibiotika nogalina daudzas nekaitīgās baktēriju sugas, kas dzīvo kuņģa-zarnu traktā. Tā rezultātā pacienti ir uzņēmīgi pret Clostridium difficile (C. diff) baktēriju infekciju, kas izraisa caureju. Šī slimība ir pazīstama ar nosaukumiem: ar antibiotikām saistīta caureja, pseidomembranozais kolīts un ar C. diff saistīta caureja.
Lai gan tas var šķist pretrunīgi, ar antibiotikām saistītu caureju ārstē ar antibiotikām. Tomēr vispirms tiek pārtraukta antibiotika, kas sākotnēji izraisīja ar antibiotikām saistītu caureju. Vienkāršus gadījumus pēc tam var ārstēt ar antibiotiku metonidazolu. Smagākos gadījumos var būt nepieciešama ārstēšana ar vankomicīnu, spēcīgāku antibiotiku. Daži ārsti lieto arī probiotikas līdzekļus pacientiem ar ar antibiotikām saistītu caureju, cenšoties atjaunot viņu kuņģa-zarnu traktu ar labvēlīgām baktēriju sugām.
Viens jautājums, kas varētu rasties, apsverot antibiotiku un caurejas lietošanu, īpaši, ja caureja sākas pēc ārstēšanas ar antibiotiku uzsākšanas, ir, vai caureja ir blakusparādība vai ar antibiotikām saistīta caureja. Notikumu secība ir svarīga, lai noteiktu cēloni. Caureja, kas ir zāļu blakusparādība, parasti sākas drīz pēc antibiotiku lietošanas. Turpretim ar antibiotikām saistīta caureja parasti sākas tikai vienu līdz divas nedēļas pēc antibiotiku lietošanas. Ja rodas neskaidrības, ar antibiotikām saistītu caureju var apstiprināt, meklējot C. diff toksīnus izkārnījumos.
Vēl viena saistība starp antibiotikām un caureju ir tāda, ka caureju var izraisīt infekcija, kuras ārstēšanai tiek lietotas zāles. Piemēram, ceļotāju caureju parasti izraisa Escherichia coli baktērijas; vairākas antibiotikas labi darbojas, lai izskaustu infekciju un apturētu caureju. Caureja, ko izraisa baktēriju sugas Yersinia enterocolitica, Listeria monocytogenes un Salmonella enteriditis, bieži vien reaģē uz antibiotikām.