Ir septiņas dažādas čakru pamata krāsas, no kurām katra apzīmē atšķirīgu ideju vai koncepciju. Šīs krāsas ir sadalītas virs korpusa un ietver sarkanu, oranžu, dzeltenu, zaļu, zilu, indigo un violetu. Hinduismā čakru krāsas attēlo enerģiju, kas, domājams, nāk no cilvēkiem un kontrolē emocijas un ķermeni.
Čakru pamatne vai sakne ir sarkana, pazīstama arī kā muladhara. Šī krāsa atspoguļo gara iezemējumu uz zemi, un tiek uzskatīts, ka tā ir atbildīga par iekļaušanas un uzticības sajūtu. Diagrammās sarkanā čakra atrodas no kājām līdz pēdām. Tiek uzskatīts, ka sarkanā čakra kontrolē mugurkaulu, imūnsistēmu un ķermeņa lejasdaļu.
Oranžā krāsa ir otrā no čakru krāsām, un to dažreiz sauc par swadhisthana. Visbiežāk pazīstamā kā auglības un seksualitātes kontrole, oranžā čakra tiek uzskatīta arī par radošuma centru. Tas atrodas no vēdera lejasdaļas līdz gurniem, un tiek uzskatīts, ka tas kontrolē dzimumorgānus un zarnas.
Dzelteno čakru parasti sauc par saules pinumu. Šī čakra ir atbildīga par personīgo spēku un spēku, un tiek uzskatīts, ka tā ir avots cilvēka spējai sasniegt savus mērķus. Trešā no čakru krāsām tiek uzskatīta par enerģiju, kas ļauj kognitīvi izprast emocionālās problēmas. Fiziskā nozīmē saules pinums kontrolē vēdera augšdaļu, kuņģi un galvenos orgānus šajā apgabalā.
Zaļā krāsa apzīmē sirds čakru, kas ir pazīstama arī kā anahata. Mūsdienu hinduisma variācijās zaļo čakru var attēlot arī rozā krāsa. Tas kontrolē ne tikai mīlestības jūtas, bet arī naidu, kā arī visas emocijas starp tām. Tiek uzskatīts, ka ceturtā no čakru krāsām kontrolē sirdi un asinis cilvēka ķermenī.
Tiek uzskatīts, ka kaklā un kaklā atrodas piektā čakra, ko attēlo zilā krāsa. Sanskritā pazīstama kā visudha, zilā čakra kontrolē ķermeņa kaklu, rokas un rokas. Hinduismā tiek uzskatīts, ka zilā čakra ir līdzsvarā tikai tad, ja cilvēks ir godīgs; melošana var nopietni ietekmēt šīs vietas fizisko veselību.
Indigo, trešās acs krāsa, atrodas uz pieres. Sestā no čakru krāsām ir atbildīga par cilvēka saikni ar savu zemapziņu, kā arī par saikni ar Visumu kopumā. Dažreiz rakstīts kā ajna, indigo čakra ir atbildīga par intuīciju, un to var izsist no līdzsvara personības integritātes trūkuma dēļ.
Violeta vai violeta apzīmē vainaga čakru, kas atrodas pašā galvas augšdaļā. Tiek uzskatīts, ka šī čakra sanskritā ir rakstīta kā sahasrara, un tā ir atbildīga par zināšanām un saikni ar augstāku spēku. Tiek uzskatīts, ka pēdējās čakru krāsas nelīdzsvarotība ietekmē katru otro čakru, tādējādi izraisot miera trūkumu cilvēka dzīvē.