Galvenās cilvēka šūnu struktūras daļas var iedalīt ārējā plazmas membrānā, parasti centrālajā kodolā, citoplazmā un dažādās citoplazmā esošajās organellās. Plazmas membrāna ir šūnas ārējā robeža, un tā kontrolē to, kas tajā nonāk un iziet no tās. Kodolam ir īpaša membrāna, un tajā ir šūnas dezoksiribonukleīnskābe (DNS). Citoplazmā ir nesošās struktūras un šķidrums, kā arī organellas, kas atrodas starp kodolu un plazmas membrānu. Organelli ir dažādas struktūras, kurām šūnā ir unikālas funkcijas.
Plazmas membrāna, kas galvenokārt sastāv no lipīdiem, piešķir cilvēka šūnu struktūrai tās pamata formu un satur pārējās šūnas daļas. Tas atdala intracelulārās daļas šūnā no ārpusšūnu telpas ārpus tās. Plazmas membrāna regulē to, kas iekļūst šūnā un iziet no tās dažādu ķīmisko procesu laikā. Tās ārpusē ir vietas, ko sauc par receptoriem, kas saņem ķīmiskus ziņojumus no citām šūnām un ļauj šūnām sazināties savā starpā. Cilvēka šūnu membrānām ir arī unikāli marķieri, kas ļauj citām šūnām atšķirt tās no svešām šūnām, piemēram, baktērijām.
Citoplazma veido pārējo cilvēka šūnu struktūru, izņemot kodolu. Citoplazmas šķidrā daļa satur fermentus, kā arī citus proteīnus un molekulas. Citoplazmā ir arī ietvars, kas cilvēka šūnu struktūrai piešķir tās pamatformu. Citoplazmā atrodamas arī citoplazmas organellas, no kurām dažas ir iesaistītas olbaltumvielu veidošanā un transportēšanā vai enerģijas nodrošināšanā šūnai.
Citoplazmas organellas ir atbildīgas par vairāku īpašu šūnu funkciju veikšanu. Viens piemērs ir ribosoma, kas ir viena vieta, kur tiek ražoti proteīni. Mitohondriji bieži tiek uzskatīti par šūnu spēkstacijām, jo tās nodrošina šūnai enerģiju. Golgi aparāts maina olbaltumvielas un lipīdus un transportē tos uz citām šūnas daļām. Lizosoma ir struktūra, kas var sadalīt lipīdus, olbaltumvielas un citas molekulas. Lizosomas dažreiz sauc par šūnu gremošanas sistēmu.
Cilvēka šūnu struktūrā kodols tiek uzskatīts par organellu, bet tam ir unikālas īpašības un savas funkcijas. Viena no šīm iezīmēm ir dubultā membrāna, kas stingrāk regulē to, kas var iekļūt un iziet no kodola. Kodols satur šūnas DNS, ko tā izmanto modificētā veidā, lai vadītu proteīnu un visu šūnas enzīmu ražošanu. Tas satur arī DNS daļas, kas veido hromosomas, kad šūna dalās.