Lai gan pelējums ir dabā sastopama sēne, pastāv daži melnās pelējuma veselības apdraudējumi, kuru smaguma pakāpe ir dažāda. Dažiem pasaules iedzīvotājiem melnais pelējums var izraisīt alerģisku reakciju. Šī reakcija var būt tikpat viegla kā nieze, asarošana vai tikpat bīstama kā nespēja elpot. Pastāv arī citi melnās pelējuma veselības riski, tostarp plaušu vai ādas sēnīšu infekcija un mikotoksīnu toksicitāte.
Melnais pelējums tiek uzskatīts par alergēnu. Tiem, kas ir jutīgi pret to, melnais pelējums var izraisīt imūnsistēmas pārmērīgu darbību, izraisot alerģisku reakciju. Melnās pelējuma alerģijas simptomi ir niezošas acis, šķaudīšana, skrāpējumi kaklā un nātrene. Smagos gadījumos melnais pelējums var izraisīt elpceļu aizvēršanos tiem, kam ir alerģija pret to, un ir nepieciešama medicīniska iejaukšanās, lai samazinātu pietūkumu un regulētu elpošanu. Dažiem astmas slimniekiem melnais pelējums dažkārt var izraisīt astmas lēkmi. Antihistamīna līdzekļus, inhalatorus un epinefrīnu var izmantot, lai novērstu, kontrolētu un ārstētu šāda veida melnās pelējuma riskus.
Dažos gadījumos melnais pelējums var izraisīt infekciju plaušās vai ādā, ja tiek ieelpotas pelējuma sporas. Tā kā melnais pelējums ir sēne, daži veidi var izraisīt infekciju dažiem cilvēkiem, īpaši tiem, kuriem ir imūnsistēmas traucējumi. Visizplatītākais infekcijas veids ir pazīstams kā aspergiloze; tā nosaukums ir atvasināts no pelējuma nosaukuma, kas to izraisa: aspergillus. Sēnīšu infekcijas simptomi plaušās ir stipras sāpes krūtīs un sēkšana. Ja infekcija netiek ārstēta, tā var izplatīties uz ādu, smadzenēm, sirdi un nierēm, un var būt nepieciešama hospitalizācija. Ja infekcija tiek konstatēta pietiekami agri, to var ārstēt ar perorāliem medikamentiem.
Viens no nopietnākajiem melnās pelējuma veselības apdraudējumiem ir mikotoksīnu toksicitāte. Melnais pelējums noteiktos augšanas posmos izdala toksīnu, kas pazīstams kā mikotoksīns. Tomēr retos gadījumos attīstās mikotoksīnu toksicitāte. Vairumā gadījumu pat vissliktākie sadzīves pelējuma gadījumi neizraisīs šo problēmu. Melnajam pelējumam ir jābūt ārkārtīgi lielam daudzumam, un cilvēkam ir jāpakļaujas tam mēnešiem, ja ne gadiem, lai attīstītu šo veselības problēmu. Ja tomēr attīstās mikotoksīnu toksicitāte, tas ir viens no bīstamākajiem melnās pelējuma veselības apdraudējumiem. Biežāk nekā nē, ir sagaidāms kāda veida nervu bojājums; ja netiek nekavējoties ārstēts, tas var būt letāls.
Lielākajai daļai cilvēku melnā pelējuma iedarbība ir tikai kairinoša. Tomēr šī sēne var būt toksiska, un melnā pelējuma iedarbība ir jāierobežo vai jāizvairās no visa kopā. Mājās, īpaši, ja ir mazi bērni, pēc iespējas ātrāk jālikvidē melnais pelējums un, ja ir liels pelējuma daudzums, jāsazinās ar speciālistu, lai saņemtu noņemšanas instrukcijas vai pakalpojumus.