Daudzus cilvēkus interesē dažādu medicīnisku problēmu naturopātijas ārstēšana, īpaši gadījumos, kad tradicionālā medicīna var nebūt efektīva. Mēģinājumiem veikt naturopātiskos ārstēšanas veidus ir vairāki plusi un mīnusi, tomēr tos ir ļoti svarīgi paturēt prātā. Lielākais mīnuss ir tāds, ka noteiktas alternatīvas ārstēšanas metodes var nebūt efektīvas un ilgtermiņā var nodarīt vairāk ļauna nekā laba; tas var arī likt cilvēkiem maldīgi domāt, ka viņi tiks izārstēti, un pārtraukt lietot izrakstītās zāles vai apmeklēt ārstu. Tomēr daži naturopātiskās medicīnas plusi ietver to, ka ir maz blakusparādību, ja tādas ir, un ka tās veicina vispārēju veselīgāku dzīvesveidu, īpaši, ja to apvieno ar citām standarta ārstniecības metodēm un ārsta uzraudzību.
Daudzos gadījumos ārsti ieteiks izmēģināt naturopātiskus līdzekļus papildus tradicionālajai medicīnai, nevis tās vietā. Tādā veidā ārsts var noteikt, vai kāds no dabiskajiem ārstēšanas veidiem var potenciāli ietekmēt citas zāles vai veselības stāvokli, un var turpināt uzraudzīt progresu. Pat ja naturopātiskais līdzeklis ir “dabisks”, tas automātiski nenozīmē, ka tas nevar mijiedarboties ar citām zālēm, kuras cilvēks lieto. Tas faktiski var nodarīt kaitējumu un pasliktināt noteiktus apstākļus. Mēģinot veikt naturopātiskos ārstniecības līdzekļus ārsta vadībā, tiek nodrošināts arī tas, ka indivīds turpinās lietot izrakstītās zāles un apmeklēt plānotos ārsta apmeklējumus; tas ir tāpēc, ka pat tad, ja alternatīvās terapijas nav aktīvi kaitīgas, dažas var vienkārši būt neefektīvas.
Protams, arī naturopātiskajai ārstēšanai ir daudz potenciālo plusu. Pirmkārt, daudzas alternatīvas terapijas veicina vispārējo veselību un stresa mazināšanu. Piemēram, sabalansēta uztura ēšana, jogas praktizēšana un akupunktūras iegūšana kopumā var būt labvēlīga, iespējams, pat novērst turpmākas medicīniskas problēmas. Turklāt naturopātiskās ārstniecības līdzekļi mudina pacientu aktīvi piedalīties savas slimības pamatcēloņa izpratnē un rīkoties, lai to ārstētu un novērstu. Tā vietā, lai ārstētu tikai simptomus, naturopātijas mērķis ir ārstēt visu ķermeni, un daži eksperti uzskata, ka šī pieeja var aktīvi palīdzēt cīņā pret slimībām.
Naturopātiskās ārstēšanas izmaksas bieži vien ir zemākas nekā tradicionālā medicīna, tāpēc tos var būt vieglāk iekļaut budžetā vai dzīvesveidā. Un otrādi, ir ļoti grūti atrast veselības apdrošinātāju, kas maksātu par alternatīvo medicīnisko terapiju, tāpēc atkarībā no ārstēšanas plāna tas var kļūt dārgs. Tomēr daudziem cilvēkiem ir vērts uzņemties šīs izmaksas, lai papildinātu medicīnisko aprūpi un ārstētu slimības, izmantojot daudzpusīgu pieeju.