Aizkuņģa dziedzeris atrodas kuņģa aizmugurē un tuvu tievai zarnai. Tam ir eksokrīna daļa, kas veido fermentus, kas nepieciešami pārtikas sagremošanai un barības vielu asimilācijai, un endokrīnā daļa, kas veido hormonus, kas nepieciešami cukura līmeņa pārstrādei asinīs. Eksokrīnajās aizkuņģa dziedzera šūnās sintezētie fermenti tiek pārnesti pa smalkiem kanāliem, kas kopā veido galveno aizkuņģa dziedzera kanālu. Šis kanāls pārvadā fermentus no aizkuņģa dziedzera uz tievo zarnu. Pirms atvēršanas tievajās zarnās aizkuņģa dziedzera kanāls savienojas ar žultsvadu, kas piegādā žulti no aknām un žultspūšļa.
Galvenais aizkuņģa dziedzera kanāls šķērso aizkuņģa dziedzeri. Pirmo reizi to atklāja vācu anatoms Johans Virsungs. Tādējādi kanālu sauc arī par Wirsung kanālu. Dažiem cilvēkiem papildus šim primārajam kanālam var būt vēl viens mazāks kanāls. Papildu kanālu sauc par Santorini kanālu.
Galvenais kanāls aizkuņģa dziedzera sekrēcijas transportē uz divpadsmitpirkstu zarnu, kas ir tievās zarnas daļa. Aizkuņģa dziedzera sulā ir gremošanas enzīmi, kas iedarbojas uz ogļhidrātiem, taukiem un olbaltumvielām pārtikā, kā arī bikarbonātiem. Īpašs šūnu veids, kas atrodas aizkuņģa dziedzera kanālos, izdala bikarbonātus, kas ir sārmains šķidrums. Sārmainais noslēpums neitralizē skābumu daļēji sagremotajam ēdienam, kas no kuņģa nonāk tievajās zarnās.
Dažreiz aizkuņģa dziedzera kanāls var tikt bloķēts, kā tas var notikt, piemēram, cilvēkiem, kuri cieš no žultsakmeņiem. Žultsakmeņi var atrauties no žultspūšļa un iesprūst aizkuņģa dziedzera kanālā, ietekmējot enzīmu plūsmu. Tas var izraisīt pankreatītu, stāvokli, kurā aizkuņģa dziedzeris kļūst iekaisusi, izraisot sāpes vēdera rajonā. Fermenti, kas parasti sāk darboties pēc tievās zarnas sasniegšanas, tiek stimulēti pašā aizkuņģa dziedzerī un var kaitēt tā audiem. Cilvēkiem, kuri lieto daudz alkohola, var attīstīties hronisks pankreatīts, kurā iekaisums un sāpes ilgst.
Dažos gadījumos var veidoties cistas, jo aizkuņģa dziedzera kanāls tiek bloķēts un uzkrājas fermentatīvais šķidrums. Cistas var palielināties, un stāvoklis var saasināt sāpes un izraisīt vemšanu. Cistas var izzust bez ārstēšanas. Dažos gadījumos cistas var būt jānoņem ķirurģiski vai arī tās var būt jāiztukšo.
Aizkuņģa dziedzera vēzis ir nopietna slimība, kas rodas, ja aizkuņģa dziedzera šūnas nenormāli vairojas un attīstās audzējos. Dažreiz aizkuņģa dziedzera kanāla šūnas sāk pārvērsties par vēzi. Šis audzēja veids visbiežāk tiek novērots cilvēkiem, kuriem diagnosticēts aizkuņģa dziedzera vēzis. Aizkuņģa dziedzera audzēju un to stadijas novērtēšanā ir iesaistīti dažādi testi un procedūras.