Akvakultūras inženierija ir iekārtu, aprīkojuma, procesu un sistēmu projektēšana, kas nepieciešamas, lai audzētu un novāktu ūdens dzīvniekus un augus komerciālos nolūkos. Visā pasaulē ir dažas formālās izglītības programmas, kas ir īpaši veltītas akvakultūras inženierijai. Cilvēkiem, kas praktizē šajā jomā, parasti ir grādi akvakultūrā, bioloģijas zinātnēs vai tradicionālās inženierzinātņu disciplīnās, piemēram, lauksaimniecības inženierzinātnēs vai vides inženierzinātnēs.
Akvakultūra ir strauji augoša nozare, kas cenšas apmierināt pieaugošo pasaules pieprasījumu pēc zivīm, vēžveidīgajiem, jūraszālēm un citām ūdens sugām. Tā kā zivis ir galvenais nozares produkts, akvakultūru parasti sauc par zivju audzēšanu. Zivis un citas ūdens sugas tiek audzētas, audzētas, iegūtas un apstrādātas kontrolētos apstākļos, kas paredzēti, lai palielinātu ražu un peļņu un samazinātu izmaksas un ietekmi uz vidi.
Zivju audzētavas un līdzīgas iekārtas ir diezgan atkarīgas no ūdens. Dažas darbības audzē ražu ārā, bieži vien būros, kas novietoti dabiskās vai cilvēka radītās ūdenstilpēs. Saldūdens sugas var audzēt dīķos vai rezervuāros, savukārt jūras sugas parasti tiek audzētas okeāna ūdeņos. Tos sauc par zemas intensitātes procesiem, jo tie notiek atklātā vidē, kur inženieriem var būt tikai ierobežota kontrole pār dažiem darbības aspektiem. Augstas intensitātes akvakultūra tiek praktizēta tvertnēs vai citās iekštelpu telpās, kur apstākļus var stingri kontrolēt un uzturēt.
Akvakultūras inženierija ir ļoti saistīta ar ūdens problēmām, jo īpaši ūdens cirkulāciju un ūdens kvalitāti. Šajās jomās ir nepieciešamas zināšanas hidroloģijā, hidraulikā un okeanogrāfijas, civilās inženierijas un vides inženierijas aspektos. Akvakultūras inženieri bieži tiek aicināti izstrādāt vai pārraudzīt sūkņu, cauruļvadu sistēmu un citu ūdens transporta iekārtu darbību un apkopi. Izšķirošas ir arī zināšanas par ūdens ķīmiju. Jūras akvakultūras darbībām, kurās izmanto jūras ūdeni, un saldūdens akvakultūras iekārtām, kurās izmanto iekšējos ūdeņus, ir ļoti atšķirīgas ūdens ķīmiskās prasības.
Atkritumu rašanās un apstrāde ir galvenās bažas zivkopībā, jo daudzi dzīvnieki atrodas ierobežotā telpā. Atkritumu materiāli ir urīns, fekālijas, neapēstā pārtika un mirušo zivju līķi. Šie atkritumi apdraud veselību ierobežotos iežogojumos esošajām zivīm un ir vides problēma iekšējos un okeāna ūdeņos. Tas nozīmē, ka lielākajā daļā liela mēroga akvakultūras objektu ir nepieciešamas atkritumu apstrādes, izvešanas un apglabāšanas sistēmas.
Bioloģijas zinātne, jo īpaši ūdens sugu bioloģija, ir vēl viena galvenā akvakultūras inženierijas sastāvdaļa. Bioloģijas zinātnes zināšanas ir nepieciešamas, lai izstrādātu un darbinātu sistēmas, kas uzturēs dzīvās radības veselīgu un plaukstošu. Tas ir arī galvenais, lai apmierinātu viņu vides vajadzības pēc reprodukcijas.
Papildus šīm pamatprasmēm akvakultūras inženierzinātnēs parasti ir nepieciešamas zināšanas citās jomās. Viens piemērs ir ēku, iekārtu un āra ūdenstilpņu vai tvertņu projektēšanas un būvniecības pārraudzība. Ūdens sugu pārstrādei galaproduktos var būt nepieciešamas specializētas iekārtas, tostarp robotika vai automatizētas sistēmas. Akvakultūras darbībās bieži izmanto sarežģītas ūdens kvalitātes uzraudzības, testēšanas un kontroles iekārtas. Var būt nepieciešama arī datormodelēšana, lai prognozētu vai simulētu ūdens kvalitātes apstākļus vai zivju ražošanu laika gaitā dažādos darbības apstākļos.