Kas ir algoritmiskā botānika?

Kā disciplīna, kas ir veltīta virtuālu līdzekļu izmantošanai, lai palielinātu zināšanu par augiem un augu dzīvi, algoritmiskā botānika nodrošina botāniķim iespēju izmantot datorrīkus, lai pētītu un simulētu vairākus dažādus scenārijus attiecībā uz augiem. Šī virtuālo rīku izmantošana virtuālo augu pētīšanai jau ir saņēmusi lielu uzmanību, un tā ir galvenā Kalgari universitātes studiju kursa uzmanības centrā.

Algoritmiskās botānikas process vislabāk tiek izteikts kā bioloģiskā modelēšana un vizualizācija, kas vairāk pazīstama kā BMV pieeja. Tieši šī pieeja ir pamatā pētījumam, kas pašlaik tiek veikts Kalgari universitātes Datorzinātņu nodaļas paspārnē. Būtībā algoritmiskās botānikas modeļi tiek izstrādāti, izmantojot datorzinātņu tehnoloģijas, kas apvienotas ar dažāda veida programmatūru, lai izveidotu virtuālu laboratoriju, kurā virtuālos augus audzē stingrās un kontrolētās situācijās. Iespēja vienlaikus palaist vairākas dažādas simulācijas palīdz ievērojami paātrināt izpētes procesu. Algoritmiskā botānika rada situāciju, kurā botāniķi var brīvi izpētīt iespējas ļoti īsā laika posmā, nevis gados vai gadu desmitos, kādi būtu nepieciešami līdzīgiem centieniem reālās dzīves apstākļos.

Kalgari universitātes BMV pētnieku grupas savā darbā nav vienas. Projektā dažādos līmeņos ir iesaistītas personas no visas pasaules. Darbs būtībā ir sadalīts trīs galvenajos komponentos. Modelēšana ir pamata sastāvdaļa, un tā ietver pamatu izveidi virtuālajiem augiem. Simulācija balstās uz modelēšanas radīto pamatu un ļauj pētniekiem ieviest virkni kontrolētu faktoru katra modeļa virtuālajā vidē. Augu vizualizācija ļauj izpētīt galaproduktu, ko rada virkne ieviesto faktoru, sniedzot vērtīgu informāciju par šo faktoru izmantošanas iespējamību un vēlamību reālajā pasaulē.

2007. gada novembrī cilvēki, kurus interesēja algoritmiskās botānikas gaita, pulcējās piektajā ikgadējā funkcionālās un strukturālās augu modelēšanas seminārā. Seminārs, kas notika Napierā, Jaunzēlandē, bija atvērts cilvēkiem, kas bija saistīti ar Kalgari universitātes projektu, kā arī neatkarīgiem pētniekiem, kuri savos centienos izmantoja kādu algoritmiskās botānikas veidu.