Baktēriju piesārņojums ir situācija, kas rodas, kad baktērijas nonāk vietā, kur tām nav jāatrodas. To bieži lieto, lai apzīmētu pārtikas piesārņojumu ar baktērijām, kas var izraisīt slimības, bet var rasties arī citos apstākļos. Šāda situācija nav vēlama, jo var radīt draudus veselībai un radīt citas problēmas. Rezultātā tiek veikti pasākumi, lai izvairītos no piesārņojuma vietās, kur tas var kļūt par problēmu.
Pārtikas gadījumā baktēriju piesārņojums var notikt daudzos posmos piegādes ķēdē no ražotāja līdz pusdienu galdam. Baktērijas var atrasties ūdenī un augsnē un pārvietoties kopā ar kultūrām. Tos var pārnest arī cilvēki, kas rīkojas ar pārtiku, vai arī tie var nonākt pārtikā, izmantojot netīras iekārtas, sākot no netīrām iepakošanas iekārtām līdz netīrām pannām restorānā. Piesārņojums ar baktērijām mājās bieži rodas tādēļ, ka ēdiens tiek atstāts ārpus letes, ēdiens netiek turēts auksts vai netiek nomazgātas rokas pirms apstrādes. Nokļūstot pārtikā, baktērijas var vairoties, padarot lēcienu pie cilvēka saimnieka, kad kāds patērē pārtiku.
Baktēriju piesārņojums var būt problēma arī medicīnas klīnikās, operāciju zālēs un citās veselības aprūpes iestādēs. Baktērijas var pārnest no pacientiem vai veselības aprūpes sniedzējiem, un tās var nonākt uz ķirurģiskiem instrumentiem, medicīnas iekārtām, durvju rokturiem un daudzām citām vietām. Veselības aprūpes iestādēs tā ir īpaši liela problēma, jo slimiem cilvēkiem ir risks saslimt vairāk, ja viņi tiek pakļauti kaitīgām baktērijām.
Zinātniskajos pētījumos problēma var būt paraugu piesārņojums ar baktērijām, tāpat kā patologa analīzei ņemto paraugu piesārņojums. Nevēlamu baktēriju klātbūtne var sabojāt eksperimentu, izmest patoloģijas rezultātus vai vienkārši sajaukt pētnieku. Baktērijas viegli izplatās laboratorijās, izmantojot dažādas virsmas, tostarp iekārtas, kas nav pareizi sterilizētas, netīras rokas un ventilācijas sistēmas.
Baktēriju piesārņojuma novēršana var būt sarežģīta. Liela profilakses sastāvdaļa ir telpu tīrības uzturēšana un pareizas apstrādes procedūras ievērošana. Vienkāršas darbības, piemēram, roku mazgāšana, apavu iegremdēšana antibakteriālā vannā pēc iziešanas no pacienta istabas un cimdu nēsāšana, lai apstrādātu paraugus, var ievērojami samazināt baktēriju pārnešanas risku no vienas vietas uz citu. Ir arī svarīgi veikt regulāras pārbaudes, lai pārbaudītu baktēriju piesārņojumu, lai to varētu identificēt, pirms tas kādu saslimst vai rada problēmas ar eksperimentu vai testu.