Dzimumlocekļa amputācija ir pilnīga vai daļēja dzimumlocekļa noņemšana no ķermeņa. To var izraisīt ievainojumi, slimība vai uzbrukums, bet, ja atdalītā daļa tiek saglabāta, ir iespējama atkārtota piestiprināšana ar gandrīz pilnīgu funkcijas atjaunošanos. Dažos gadījumos dzimumlocekļa amputācija tiek veikta ar operācijas palīdzību pārliecinošu medicīnisku iemeslu dēļ vai kā daļa no dzimumu maiņas procesa. Kopumā mūsdienās tā ir reta parādība.
Agrāk uzvarējušie karavīri reizēm amputēja savu uzvarēto pretinieku dzimumlocekļus, kalpojot trofeju izņemšanai un slepkavību skaitīšanai, kā arī demonstrējot uzvarētāja pārākumu. Lai gan par šo praksi ik pa laikam tiek ziņots pat mūsdienu karu laikā, tā nav kļuvusi par standarta praksi.
Dažkārt var būt nepieciešama ķirurģiska dzimumlocekļa amputācija – penektomija, lai risinātu noteiktus apstākļus, vienmēr kā pēdējo līdzekli. Dažas vēža formas var izraisīt, piemēram, penektomiju, un retos gadījumos nepareizi veikta apgraizīšana galu galā var izraisīt penektomiju. No otras puses, dzimumlocekļa maiņas operācija parasti neprasa pilnīgu dzimumlocekļa amputāciju, bet gan dzimumlocekļa pārveidošanu par maksts sastāvdaļām. Ja tas nav iespējams, var tikt pieprasīta procedūra, ko sauc par kolovaginoplastiku, kas prasa pilnīgu dzimumlocekļa izņemšanu.
Dzimumlocekļa ievainojums ir visizplatītākais ķirurģiskas dzimumlocekļa amputācijas iemesls. Dzimumlocekļa lūzums vai cits ievainojums seksuālo attiecību laikā ir visizplatītākais dzimumlocekļa ievainojuma veids, kam seko šaušanas un durtas brūces, kas visbiežāk rodas kaujas laikā. Negadījumi masturbācijas laikā arī rada ievērojamu skaitu dzimumlocekļa traumu. Vienprātība ir tāda, ka par dzimumlocekļa ievainojumiem, kas saistīti ar seksuālo aktivitāti, netiek ziņots, jo tas var radīt apmulsumu, īpaši masturbācijas gadījumos.
Pilnīga vai daļēja dzimumlocekļa amputācija var būt nepieciešama arī ārkārtējos priapisma gadījumos, kas ir sāpīgs stāvoklis, kad erekcija nesamazinās. Medicīniskā literatūra dokumentē priapisma gadījumus vīriešiem, kuri lieto noteiktus medikamentus kopā ar zālēm erektilās disfunkcijas ārstēšanai. Vairumā gadījumu šādu erekciju var novērst ar mazāk ekstrēmiem pasākumiem, bet ekstremālās situācijās var būt norādīta pilnīga vai daļēja penektomija.
Lai gan joprojām ir diezgan reti, visizplatītākā dzimumlocekļa amputācija ir traumatiska. Parasti kaislības noziegums, ko izdara laulātie vai mīļākie, lai atriebtos par neuzticību, tas notiek biežāk mazāk attīstītajās valstīs nekā industrializētajos Rietumos. Laiku pa laikam kāds gadījums kļūs slavens kāda jauna pamata apstākļu elementa dēļ. Piemēram, 20. gadsimta beigās kāda amerikāniete vārdā Lorēna Bobita pēc tam, ko viņa raksturoja kā laulātā izvarošanu, ar grebšanas nazi izņēma sava vīra dzimumlocekli un pēc tam izmeta ērģeles laukā. Šīs situācijas sensacionālais elements bija tas, ka nogrieztais dzimumloceklis tika atgūts un atkal piestiprināts, un viņas vīrs vēlāk ziņoja, ka orgāns ir pilnībā atguvis savu funkcionalitāti. Dzimumlocekli var veiksmīgi atkārtoti piestiprināt 16 stundu laikā vai nedaudz ilgāk, ja tas ir iesaiņots ledū.