Kas ir etanola nokrišņi?

Etanola izgulsnēšana ir DNS ekstrakcijas process, kurā šis materiāls tiek izvadīts no sāļa šķīduma, pievienojot etanolu. DNS ir divu negatīvi lādētu fosfāta-cukura mugurkaula dubultspirāle, pa kuru ir savienotas nukleīnskābes, tāpēc pozitīvi lādēti joni, piemēram, kalcijs vai nātrijs, tiks piesaistīti tās mugurkaulam. Gan jonu sāļi, gan DNS viegli šķīst ūdenī, bet ne tik viegli etanolā, jo tiem abiem ir nepieciešams polārs šķīdinātājs, piemēram, ūdens, lai atdalītos. Tāpēc etanola pievienošana sāļajam šķīdumam izraisa DNS nogulsnēšanos un nogulsnēšanos no šķīduma.

DNS ir polāra molekula, un, tā kā “līdzīgs izšķīst līdzīgu”, polārās molekulas viegli izšķīst polārajos šķīdinātājos. Lai gan DNS viegli šķīst ūdenī, tā nešķīst mazāk polārā šķīdinātājā, piemēram, etanolā. Etanols joprojām ir polāra molekula, taču tai ir īsa, nepolāra oglekļa ķēde. Šī nelielā polaritātes atšķirība ļauj notikt etanola nogulsnēšanai, pamatojoties uz DNS nespēju šķīst tikpat viegli etanolā kā ūdenī.

Ja eksperimentētājs tieši pievienotu etanolu izšķīdušas DNS šķīdumam ūdenī, molekula neizgulsnētu. Tas ir tāpēc, ka DNS joprojām ieskauj polāras ūdens molekulas un polārās grupas uz etanola, kas varētu darboties kā vairogs, atdalot uzlādēto DNS no neuzlādētajām etanola oglekļa ķēdēm. Sāls ir izrādījies būtisks faktors šajā procesā.

Pievienojot šķīdumam sāli pirms etanola pievienošanas, DNS tiek atbrīvota no paļaušanās uz ūdeni kā polaritātes vairogu. Sāls pozitīvie elementi, kas disociējas un ir brīvi peldoši pozitīvi lādēti joni ūdenī, tiek spēcīgi piesaistīti DNS negatīvajam lādiņam. Šī sāls pievilcība liek DNS piesaistīt šiem joniem, nevis ūdens molekulu pozitīvajai polaritātei, ļaujot tai viegli atrauties no ūdens, kad tiek pievienots mazāk polārs šķīdinātājs, piemēram, etanols.

Ļaujot DNS piesaistīt kalcijam vai citiem pozitīvi lādētiem joniem, pēc tam izgulsnējot sāli no šķīduma, samazinot ūdens saturu, pievienojot etanolu, zinātniekiem tiek nodrošināta metode, ar kuras palīdzību DNS var izvadīt no šķīduma. Daudzi pētījumi balstās uz DNS izolāciju un apstrādi ģenētiskajiem ekrāniem un proteīnu ekspresijai, tāpēc daudzi eksperimentētāji uzskata, ka etanola nogulsnēšana ir izrādījusies nenovērtējams zinātnisks instruments.