Gēnu fonds atspoguļo kopējo alēļu skaitu, kas ir sadalīts starp sugas vaislas populāciju. Alēle ir viena no gēna formām: piemēram, gēns, kas kodē acu krāsu cilvēkiem, cita starpā ietver alēles zilām, zaļām, brūnām un lazdu acīm. Cilvēki var atsaukties uz gēnu fondu konkrētam gēnam, piemēram, matu krāsai, vai sugai kopumā.
Parasti, jo lielāks ir genofonds, jo labāk ir sugai, jo tas atspoguļo daudzveidību. Daudzveidība mēdz veicināt izturību. Ja populācija nav ļoti daudzveidīga, var pastiprināties negatīvās alēles, kas var būt bīstamas populācijai ilgtermiņā. Piemēram, dzīvnieku sugā, kurā daudziem dzīvniekiem ir alēle, kas vājina kāju kaulus, nākamajām paaudzēm biežāk būs vājas kājas, savukārt daudzveidīgā populācijā, kur šī alēle ir tikai dažiem īpatņiem, to skaits būs mazāks. Dzīvniekiem šī problēma radīsies nākotnē, jo ir mazāk cilvēku, kas to nodod tālāk.
Gēnu fonda lielumu var ietekmēt vairākas lietas. Svarīgs ir kopējais organismu skaits, tāpat kā attiecības starp organismiem. Jo vairāk sugas pārstāvju, jo lielāka daudzveidības iespēja un jo mazāk tiešu ģenētisko attiecību starp dzīvniekiem, jo mazāka iespēja negatīvo alēļu pastiprināšanai radniecības rezultātā. Spontānas mutācijas populācijā var arī palielināt gēnu fonda lielumu, un dažas sugas ir slavenas ar savu augsto mutāciju līmeni.
Gēnu kopas ir interesantas vairāku iemeslu dēļ. Lopkopju un dzīvnieku audzētāju vidū ir vēlams daudzveidīgs gēnu kopums, lai izveidotu veselīgu vaislas dzīvnieku populāciju. Īpaši lielas bažas tas rada selekcionāriem, kuri strādā ar tīršķirnes dzīvniekiem, jo tīršķirnes var radīt problēmas, kas saistītas ar radniecīgu dzīvnieku audzēšanu atļauto dzīvnieku ierobežojumu dēļ. Dabas aizsardzības speciālisti ir arī norūpējušies par gēnu atlasi, jo apdraudētās sugas var sasniegt kritiskās masas punktu, kuru pārsniedzot, tās neizdzīvos, jo to populācijas samazinās un genofonds kļūst mazāk daudzveidīgs.
Pētnieki, kas interesējas par genofondu augšanu un saraušanos, bieži strādā ar augļu mušām, jo tās ātri vairojas un tās jau sen tiek izmantotas ģenētikas pētījumos. Strādājot ar rūpīgi kontrolētām augļu mušu populācijām, ģenētiķi un citi pētnieki var izpētīt dažādu ietekmju ietekmi uz sugas ģenētisko veselību.