Hipotēkas deficīts rodas, ja mājoklis tiek pārdots vai atsavināts par mazāku summu, nekā ir parādā hipotēkā. Piemēram, ja mājas vērtība kopš iegādes brīža ievērojami samazinās, mājas īpašnieks var būt spiests to pārdot par daudz mazāku summu, nekā ir hipotēkā. Atšķirība starp to, kas saņemts par mājokļa pārdošanu, un to, kas vēl ir parādā, ir hipotēkas iztrūkums. Personas, kuras hipotēkas apdrošināšanu iegādājas pirmo reizi, varēs saņemt no apdrošināšanas sabiedrības šos iztrūkstošos līdzekļus, lai atmaksātu bankai; tomēr vairumā gadījumu apdrošināšanas sabiedrība atgriezīsies un nāks pēc mājas īpašnieka pēc šiem līdzekļiem vēlreiz.
Bankai, kurai ir hipotēka, tiešām nav svarīgi, vai māja tiek atsavināta, vai arī mājas īpašnieks māju pārdod patstāvīgi; viņi vienkārši vēlas savākt to, kas ir parādā par hipotēku. Ja mājas īpašnieks to nemaksā, banka parasti būs motivēta uzsākt tiesvedību pret aizņēmēju, līdz viņš atgūs līdzekļus. Dažos gadījumos mājas pārdošanas izmaksas, piemēram, novērtējuma maksas, nekustamā īpašuma maksas un slēgšanas izmaksas, var pat pievienot hipotēkas deficītam, vēl vairāk palielinot parādu.
Kā minēts iepriekš, civiltiesiskās atbildības apdrošināšanu var izmantot, lai samaksātu aizdevējam hipotēkas iztrūkuma starpību. Apdrošināšanas sabiedrība tomēr pieprasīs šos līdzekļus, tāpēc tie praktiski vienmēr būs jāmaksā. Daži cilvēki ir spiesti pasludināt bankrotu, ja nevar samaksāt hipotēkas iztrūkuma starpību. Citi mēģina citus ceļus, piemēram, mēģina norēķināties ar banku par pēdējo maksājumu, pat ja tas nav par visu parāda summu. Eksperti iesaka šāda veida līgumu vienmēr noslēgt rakstiski, lai banka nevarētu turpināt pieprasīt maksājumu pēc norēķināšanās.
Ja mājas īpašnieks ir spiests pārdot māju ar hipotēkas deficītu, tas paliks viņa kredītvēstures pārskatā. Tas var apgrūtināt mājokļa iegādi nākotnē vai jebkura cita veida aizdevuma saņemšanu, sākot no privātā aizdevuma līdz auto aizdevumam. Māju īpašniekiem parasti tiek ieteikts veikt visus iespējamos pasākumus, lai izvairītos no hipotēkas iztrūkuma, un, ja māju nav iespējams pārdot par hipotēkas vērtību, veikt pasākumus, lai pēc iespējas ātrāk atrisinātu parādu, lai samazinātu negatīvo ietekmi uz kredītu.