Elementu zinātnieki izmanto mikroviļņu gremošanu kā skābās gremošanas metodi, lai izšķīdinātu metālus, lai sasniegtu mērījumus, kas saistīti ar atomu emisijām vai panāktu atomu absorbciju. Tādējādi šķelšana mikroviļņu krāsnī ir definēta kā paņēmiens, ko izmanto metālu šķīdināšanai skābē, paaugstinot gan temperatūru, gan spiedienu, izmantojot starojumu. Mikroviļņu krāsnis, kas paredzētas lietošanai laboratorijā, ir instrumenti, ko parasti izmanto procesa veikšanai. Priekšrocības, kas raksturīgas šim procesam, ir saistītas ar laika samazināšanu, kas nepieciešams, lai panāktu sagremošanu, kas ir dažu minūšu jautājums, izmantojot mikroviļņu fermentāciju, pretstatā stundām, kurās tiek izmantotas citas praktiski izmantojamas metodes, piemēram, šķelšanās plīts. Tomēr ļoti svarīgi, lai process noritētu droši un precīzi, ir nodrošināt, lai gan mikroviļņu krāsns, gan paraugs būtu pareizi sagatavoti.
Šim procesam ir svarīgi sagatavot mikroviļņu krāsni, lai droši un efektīvi apstrādātu mikroviļņu fermentācijas paraugu. Drošības apsvērumi ir saistīti ar zināšanām, kā pareizi darbināt mikroviļņu krāsni. Norādījumi par to atšķirsies dažādiem laboratorijās izmantotajiem modeļiem. Tāpēc studentiem un zinātniekiem būs jāpārskata cepeškrāsns lietošanas instrukcija, pirms mēģināt to darbināt. Arī laboratorijas parasti publicē īpašas politikas šādu iekārtu ekspluatācijai uz vietas, un lietotājiem būs jāiepazīstas ar šīm politikām un tās jāievēro.
No otras puses, parauga sagatavošana ir diezgan vienmērīga neatkarīgi no sagatavotāja. Lai gan daži paraugi ir sagatavoti nedaudz savādāk nekā citi, visiem paraugiem būs daži sagatavošanas noteikumi, kas jāievēro. Procesa veikšana ietver skābes šķīduma ievietošanu traukā, kas spēj apstrādāt skābos šķīdumus un starojumu, pēc tam parauga nomešanu traukā pirms tā aizzīmogošanas. Lai sagatavotu paraugu, tam ir jābūt tīram un sausam, pirms tas tiek pakļauts skābes iedarbībai, bet traukam jāatbilst tiem pašiem standartiem. Papildu mitrums vai daļiņas var izraisīt mikroviļņu krāsns pārāk karstumu iekšpusē un izkausēt trauku, kurā ir šķīdums, radot bīstamu situāciju.
Iepriekšēja pārstrāde ir arī svarīgs solis, kas jāveic, sagatavojot nezināmus paraugus šķelšanai mikroviļņu krāsnī. Tas ir arī obligāts solis, ja ir aizdomas, ka paraugs satur reaktīvas vielas. Parasti process ietver iepriekšēju parauga sagatavošanu un pēc tam ļauj traukam nostāvēties uz letes vismaz 15 minūtes, lai noteiktu reakciju pirms parauga iesniegšanas mikroviļņu šķelšanai. Turklāt neatkarīgi no parauga ir svarīgi ņemt vērā, ka pēc pārstrādes pabeigšanas visās laboratorijās pirms izņemšanas no mikroviļņu krāsns būs noteikts ieteicamais atdzišanas periods. Visiem lietotājiem būs jāievēro publicētā politika, lai mazinātu bīstamas avārijas risku.